نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

• ندا صبا ¹
• رحیمه سپهری ²
• محمدطاهر هرکی نژاد ¹

¹ گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، ایران

² گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان

چکیده

در اکثر نژادهای گوسفند به‌ویژه نژادهای داخل ایران، تولیدمثل فصلی است. هورمون ملاتونین نقش مهمی در تولید‌مثل فصلی دارد در پژوهش حاضر، چند‌شکلی(های) موجود در اگزون شماره دو ژن MTNR1A در گوسفند افشاری در دو گروه نمونه‌های تصادفی (35 راس) و غیرفصلی (44 راس) بررسی شد. پس از استخراج DNA از نمونه خون دام‌ها و طراحی پرایمرهای اختصاصی جهت تکثیر قطعه مورد نظر (بخش انتهایی اینترون یک، کل اگزون شماره دو و بخش ابتدایی اینترون دو)، تکثیر این قطعه با دستگاه PCR انجام و شناسایی چند‌شکلی(های) موجود به کمک توالی‌یابی تعدادی از نمونه‌ها صورت گرفت. توالی‌ها در نرم‌افزارهای Chromas lite و ClC Main Workbench 5 بررسی شدند. یک چند‌شکلی در نوکلئوتید 408 از قطعه تکثیر شده (منطبق بر چندشکلیC519C>T از توالی cDNA) شناسایی شد. با تعیین ژنوتیپ‌ محصولات توالی یابی نشده به کمک RFLP، سه ژنوتیپ CC، CT و TT به ترتیب فراوانی‌های 78/0، 1/0، 11/0 شناسایی شدند. براساس نتایج حاصله، در کل داده‌ها، فراوانی آلل C وآلل T به‌ترتیب، 835/0 و 165/0 بود. ولی در گروهی که آبستنی غیر‌فصلی داشتند، آلل T فراوانی بیشتری داشت. همچنین، همبستگی مثبت و معنی‌داری بین ژنوتیپ و تولید‌مثل غیرفصلی مشاهده شد(r=0.36, p=0.0001) . بررسی نسبت Odds نیز نشان داد که احتمال وجود آلل T در این گروه 19 برابر بیشتر از گروه تصادفی می-باشد. لذا، احتمالا آلل T با غیر‌فصلی بودن تولید‌مثل این گوسفندان مرتبط است. با توجه به نتایج بدست‌آمده و در صورت تأیید نتایج فوق در مطالعات تکمیلی، از چند‌شکلی فوق می‌توان در جهت بهبود وضعیت تولید‌مثلی گوسفند استفاده نمود.

کلیدواژه‌ها

• گوسفند افشاری
• تولید‌مثل غیرفصلی
• ملاتونین
• اگزون دو
• چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی

موضوعات

• ژنتیک

عنوان مقاله [English]

Identification of allelic variants of melatonin receptor (MTNR1A) in a population of Afshari ewes

نویسندگان [English]

• Neda Saba ¹
• Rahimeh Sepehri ²
• Taher Harkinezhad ¹

¹ Department of Animal Science, Faculty of agriculture, University of Zanjan, Zanjan, Iran.

² Department of Animal Science, Faculty of agriculture, University of Zanjan. Zanjan , Iran.

چکیده [English]

The reproduction of most breeds of sheep, especially the Iranian breeds, is seasonal. The hormone melatonin plays an important role in seasonal reproduction. The purpose of this research was to examine the polymorphism(s) in exon two of the MTNR1A gene in Afshari sheep in two groups of random and non-seasonal samples (35 randomly selected ewes and 44 spring calving ewes). After extracting DNA from blood samples and designing specific primers, the target DNA was amplified by the PCR method. Based on the results of the sequence analysis in some samples, a polymorphism at nucleotide 408 of the amplified fragment was identified (corresponding to the C519C>T polymorphism of the cDNA sequence). Genotype identification of non-sequenced samples was performed by PCR-RFLP. All three genotypes of this SNP: CC, CT and TT with frequencies of 0.78, 0.1 and 0.06, respectively, were observed. The frequency of the C allele (0.835) was higher than that of the mutant allele. However T allele had a higher frequency in the non-seasonal group. In addition, a positive and significant correlation between genotype and seasonal reproduction was observed (r=0.36, p-value=0.0001). Analysis of the odd ratios also showed that the T allele was 19 times more likely to occur in the non-seasonal group than in the random group. In general, it appears that the T allele in this position correlates with non-seasonal reproduction in sheep. If this results can be confirmed in further studies, the mentioned polymorphism can be used in breeding schemes to improve the reproductive status of sheep.

کلیدواژه‌ها [English]

• Afshari sheep
• melatonin
• Exon2
• non-seasonal reproduction
• SNP