بهینه‎ ‎سازی محیط کشت باسیلوس سویه‎ AGh1 ‎‏ جهت تولید آنزیم‎ ‎‏ اندو-4،1-بتا-‏دی-گلوکاناز و تعیین ویژگی های آن

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 پژوهشکده زیست‎‌‎فناوری، سازمان پژوهش‌های علمی و صنعتی ایران، تهران، ایران، ‏
2 عضو هیئت علمی- سازمان پژوهش های علمی و صنعتی ایران
3 پژوهشکده زیست‎ فناوری، سازمان پژوهش های علمی و صنعتی ایران، تهران، ایران، ‏
4 گروه زیست فناوری، موسسه فناوری گواهاتی هند ، گواهاتی، آسام، هند
چکیده
آنریم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز مقاوم به حرارت که به عنوان آنزیم چگالی‌انداز در تجزیه سلولز شناخته می‌شود، یکی از ‏آنزیم‌های پرکاربرد در صنعت به شمار می‌آید. در این پژوهش، پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از ‏باسیلوس سویه ‏AGh1‎‏ که از چشمه آبگرم استان اردبیل جداسازی شده بود، بررسی شد. سپس تولید آنزیم طی دو ‏مرحله بهینه سازی گردید. نخست، سبوس برنج و عصاره مخمر به عنوان عوامل اثر گذار بر تولید آنزیم توسط آزمون‌ ‏پلکت- برمن، تعیین و سپس ‏‎ ‎محیط کشت با روش سطح پاسخ بهینه‌سازی شد. مقدار بهینه این دو منبع اثر گذار بر ‏تولید آنزیم شامل به‌ترتیب 8/58 و 87/14 گرم در لیتر مشخص شد. آنزیم در دمای 60 درجه سانتی‌گراد و ‏pH‏ 6 الی ‏‏10 ، 83 الی 94 درصد پایداری خود را حفظ کرد. دما و ‏pH‏ بهینه برای فعالیت آنزیم به ترتیب 70 درجه سانتی‌گراد و ‏‏6/5 بود. در این شرایط فعالیت آنزیم 12/0 ± 16/10 میکرومول در دقیقه در میلی‌لیتر بود. در این پژوهش مشخص شد ‏که باکتری باسیلوس سویه ‏AGh1‎‏ توان تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز با فعالیت نسبتاً مناسب با استفاده از ‏ماده اولیه سبوس برنج به عنوان پسماند صنایع کشاورزی و ارزان دارد. با توجه به فعالیت مطلوب و خصوصیت مقاومت ‏حرارتی آنزیم در دامنه وسیع ‏pH، آنزیم تولیدی به عنوان آنزیمی با پتانسیل کاربرد بالا معرفی شد که نیازمند مطالعات ‏تکمیلی است.‏

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله English

Optimization of Bacillus sp. AGh1‎‏ ‏culture medium for‏ ‏production of Endo-1,4-β-D-glucanase and the enzyme characterization

نویسندگان English

Hasan Diba 1
Jafar Hemmat 2
Mohsen Vaez 3
Arun Goyal 4
1 Biotechnology Department, Iranian Research Organization for Science and Technology ‎‎(IROST), Tehran, Iran, ‎
2 Biotechnology Department, Iranian Research Organization for Science and Technology ‎‎(IROST), Tehran, Iran, ‎
3 Biotechnology Department, Iranian Research Organization for Science and Technology ‎‎(IROST), Tehran, Iran, ‎
4 Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Guwahati (IITG), Assam, India.
چکیده English

Thermostable Endo-1,4-β-D-glucanase, known as a density reducer in cellulose ‎degradation, is one of the most widely used enzymes in industries. In this study, the ‎thermostability of Endo-1, 4-β-D-glucanase produced by Bacillus sp. AGh1 which was isolated from ‎a hot-spring in Ardabil province, Iran was evaluated. The enzyme production was optimized through two steps. Rice bran and yeast extract ‎were determination as the effective factors for enzyme production by Plackett-‎Burman method, and optimization of culture medium was performed by Response Surface ‎Methodology method. The amount of mentioned effective factors for producing the enzyme ‎were 58.8 and 14.87 g L-1, respectively. The optimum temperature and pH ‎for the enzyme activity were 70 ̊C and pH 5.6, respectively. Accordingly, Bacillus sp. ‎AGh1 can produce endo-1,4-β-D-glucanase enzyme from rice bran as cheap raw ‎material with suitable activity. Consequently, the enzyme has functional at the wide ‎range of pH and may be applied which needs more studies.‎

کلیدواژه‌ها English

Bacillus
Cellulase
thermostability
Endo-1
4-&‌‌‌‌‌‌‌‌beta
-D-glucanase

بهینه­سازی محیط کشت باسیلوس سویه AGh1 جهت تولید آنزیم اندو-4،1-بتا- دی-گلوکاناز و تعیین ویژگی­های آن

حسن دیبا1، جعفر همت1*، محسن واعظ1 و آرون گویال2

1 ایران، تهران، سازمان پژوهش‌های علمی و صنعتی ایران، ‏پژوهشکده زیست‎‌‎فناوری

2 هند، آسام، گواهاتی، موسسه فناوری گواهاتی هند، گروه علوم زیستی و مهندسی زیستی

تاریخ دریافت: 04/05/1402          تاریخ پذیرش: 19/09/1402

چکیده

آنریم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز مقاوم به حرارت که به عنوان آنزیم چگالی­انداز در تجزیه سلولز شناخته می­شود، یکی از آنزیم­های پرکاربرد در صنعت به شمار می­آید. در این پژوهش، پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از باسیلوس سویه AGh1  که از چشمه آبگرم استان اردبیل جداسازی شده  بود، بررسی شد. سپس تولید آنزیم طی دو مرحله بهینه سازی گردید. نخست، سبوس برنج و عصاره مخمر  به عنوان عوامل اثر گذار بر تولید آنزیم توسط آزمون­ پلکت- برمن، تعیین و  سپس  محیط کشت با روش سطح پاسخ بهینه­سازی شد. مقدار بهینه  این دو منبع اثر گذار بر تولید آنزیم شامل به­ترتیب 8/58 و 87/14 گرم در لیتر مشخص شد. آنزیم در دمای 60 درجه سانتی­گراد  و  pH 6 الی 10 ، 83 الی 94 درصد پایداری  خود را  حفظ کرد. دما و pH بهینه برای فعالیت آنزیم به ترتیب 70 درجه سانتی­گراد و 6/5 بود.  در این شرایط فعالیت آنزیم 12/0 ± 16/10 میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر بود. در این پژوهش مشخص شد که باکتری باسیلوس سویه AGh1 توان تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز با فعالیت نسبتاً مناسب با استفاده از ماده اولیه سبوس برنج به عنوان پسماند صنایع کشاورزی و ارزان دارد. با توجه به فعالیت مطلوب و خصوصیت مقاومت حرارتی آنزیم در دامنه وسیع pH، آنزیم تولیدی به عنوان آنزیمی با پتانسیل کاربرد بالا معرفی شد که نیازمند مطالعات تکمیلی است.

کلمات کلیدی: باسیلوس، سلولاز، پایداری حرارتی، اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز

* نویسنده مسئول، پست الکترونیکی: j.hemmat@gmail.com

مقدمه

 

بیشترین مقدار پلی­مر زیستی موجود روی زمین مربوط به ترکیبات سلولزی است (12، 21) که تولید تقریبی 100 میلیارد تن در سال را به همراه دارند (12). سلولز در طبیعت بین گیاهان، جلبک­ها و قارچ­ها دیده می­شود (13)، به­طوریکه حدود 40 درصد ترکیبات کربن دار را به عنوان عنصر ساختمانی و شکل دهنده دیواره سلولی در گیاهان به خود اختصاص داده است (12). سلولازها که ترکیبات سلولزی را می­شکنند، یکی از مهم‌ترین آنزیم‌های صنعتی برای اکثر فرآیندهای تبدیل زیستی به شمار رفته (1) و در صنایع مختلف نظیر غذا و نوشیدنی، غذای حیوانات، نساجی، چرم، کاغذ و خمیر کاغذ کاربرد وسیعی دارند. پلی­مر سلولز را می­توان به عنوان منبع ارزشمندی از گلوکز یا دیگر ترکیبات مونو و اولیگوساکاریدی قابل تخمیر در تولید حلال­های اتانول، استون و بوتانول نیز دانست. آنزیم­های سلولازی که فیبر سلولزی را می­شکنند، به­صورت خارج سلولی عمل کرده و برای این ­منظور فعالیت سه آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز (EC 3.2.1.4)( Endo-1,4-β-D-glucanase)، اگزو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز (EC 3.2.1.91)( Exo-1,4-β-D-glucanase) و بتا-گلوکوزیداز (EC 3.2.1.21)( β-glucosidase) به صورت متوالی و به­صورت هم افزا (Synergistic action) عمل می­کنند (11، 6). از آنجاییکه آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز به­صورت تصادفی به بخش­های داخلی بی­شکل زنجیره سلولزی حمله کرده و زنجیره­های جدید الیگوساکاریدی با طول­های متفاوت ایجاد می­کند، بین سلولازها به آنزیم چگالی انداز معروف بوده و بیشترین کاربرد را در صنایع دارد (17).

با توجه به اینکه دمای بالا تأثیر به­سزایی در کاهش ویسکوزیته و افزایش حلالیت بسیاری از ترکیبات، بالاخص ترکیبات خاص پلی­مری دارد، بازدهی واکنش در دمای بالا بیشتر بوده و بسیاری از واکنش­های صنعتی مرتبط با پلی­مرها در دمای بالا انجام می­شوند (17، 20). بسیاری از آنزیم­هایی که در دمای بالا فعال هستند، از میکروارگانیسم­های ترموفیل یا ترموتولرنت به دست آمده اند. چنین میکروارگانیسم­هایی که بر شرایط سخت فایق می­آیند، دارای ویژگی­های خاص از جمله آنزیم­های جدید و مسیرهای بیوشیمیایی ویژه هستند (7، 25) که احتمال داشتن ویژگی­های متناسب با فرآیندهای صنعتی در آنزیم­های حاصل از آنها را بالا می­برد (29).

مطالعاتی در زمینه دست­یابی به آنزیم­های پایدار در دمای بالا از میکروارگانیسم­های ترموفیل یا ترموتولرنت حاصل از چشمه­های آب­گرم انجام شده است. موزدا و همکاران فعالیت سلولازی حاصل از دو سویه باسیلوس CH43 (Bacillus sp. CH43) و HR68 (Bacillus sp. HR68) جداسازی شده از چشمه­های آب­گرم زیمباوه را بررسی کرده و بیان داشتند که بهینه این فعالیت در pH 5 الی 5/6 و به ترتیب در دمای 65 و 70 درجه سانتی­گراد بود. (19). عزیزی و همکاران باکتری  ایزوپتریکولا واریابیلیس IDAH9 (Isoptericola variabilis) را از چشمه­های آب­گرم دهلران در ایلام جداسازی کردند و به بهینه­سازی محیط کشت این سویه جهت بهبود تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز پرداختند و بیان کردند که این میکروارگانیسم بیشترین میزان تولید سلولاز را در غلظت 9 گرم در لیتر CMC، 6/5 گرم در لیتر آمونیوم سولفات، 6/0 درصد توئین 80 و 2 درصد سوکروز دارد. همچنین بیان داشتند که آنزیم تولیدی پایداری 1 ساعته در دمای 65 درجه سانتی­گراد دارد (4). آزادیان و همکاران که سویه باسیلوس لچینیفورمیس AMF-07 (Bacillus licheniformis) را از یکی از چشمه­های آب­گرم استان کرمان جداسازی کرده اند، بیان نموده اند که آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از این سویه در رنج وسیع دما و pH به ترتیب 40 تا 80 درجه سانتی گراد و 6 الی 10 فعال بوده و دما و pH بهینه به ترتیب 70 درجه سانتی­گراد و 9 دارد (3). شاجهان و همکاران باکتری ترموفیل باسیلوس لچینیفورمیس (Bacillus licheniformis) تولید کننده آنزیم سلولاز را از یکی از چشمه­های آب­گرم در هند جداسازی کرده و پس از بهینه­سازی محیط کشت با RSM میزان فعالیت آنزیم سلولاز را تا 3 برابر افزایش دادند. (26). ایرفان و همکاران سویه باکتریایی باسیلوس آمیلولیکوئیفشیانس AK9 (Bacillus amyloliquefaciens) را از چشمه آب گرم تاتاپانی در کشمیر پاکستان جداسازی کردند که اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از این سویه در رنج وسیع دما و pH به ترتیب 50 تا 70 درجه سانتی گراد و 3 الی 6 فعال بوده و حداکثر پایداری آن در دما و pH بهینه برای فعالیت آنزیم به ترتیب 50 درجه سانتی­گراد و 5 گزارش کرده اند (15). در این پژوهش جهت بررسی امکان استفاده از قابلیت­های باسیلوس سویه AGh1 که از قبل جداسازی شده بود (8)، پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از آن در pHهای مختلف بررسی شد. سپس بهینه­سازی محیط کشت باکتری با استفاده از پسماند صنایع کشاورزی به عنوان منابع ارزان قیمت جهت تولید اقتصادی و بیشتر آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز انجام شد. پس از آن، فعالیت­های بتا-گلوکوزیدازی و بررسی فیلتر کاغذی حاصل از این سویه نیز مطالعه شد.

مواد و روشها

دست­یابی به سویه باکتریایی: سویه باکتریایی باسیلوس

AGh1 که از قبل جداسازی شده بود و  محیط مندل و گلیسرول 15 درصد در دمای منفی 80 درجه سانتی گراد نگهداری می­شد (8)، در این پژوهش استفاده شد.

سنجش فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکناز  با روش CMC/DNS : بررسی فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز با روش CMC/DNS (Carboxymethyl cellulose/Dinitrosalicylic) انجام ­شد. بدین­منظور، محلول CMC-Na در بافر 05/0 مولار مختص به pH مورد آزمون  تهیه شد. 5/0 میلی­لیتر از سوبسترا در لوله آزمایش ریخته شد سپس 5/0 میلی­لیتر محلول حاوی آنزیم به سوبسترا اضافه و 30 دقیقه در دمای مورد آزمون قرار گرفت. 3 میلی­لیتر محلول DNS به لوله آزمایش اضافه شده و 5 دقیقه در آب جوش قرار داده شد و سریعاً به یخ در حال ذوب منتقل شد. پس از افزودن 20 میلی­لیتر آب مقطر به لوله آزمایش و صفر کردن اسپکتروفتومتر، جذب نوری در طول موج 540 نانومتر خوانده شد. پس از محاسبه مقدار قند آزاد شده فعالیت آنزیم روی سوبسترای CMC-Na بر مبنای واحد بین المللی در هر میلی لیتر (میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر (µmol min-1 mL-1)) محاسبه شد(8، 9).

بررسی پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در pHهای مختلف: پایداری حرارتی فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در زمان­های صفر، 2، 4، 6 و 8 ساعت در دمای 60 درجه سانتی گراد با روش CMC/DNS در pHهای 6، 8 و 10 سنجش شد. در این مرحله فعالیت آنزیمی در زمان صفر 100 درصد در نظر گرفته و با گذشت زمان، میزان فعالیت آنزیم  باقیمانده به عنوان پایداری حرارتی در pH های مورد آزمون بررسی شد.

بهینه­سازی محیط کشت: رسم منحنی رگرسیون خطی واحد تشکیل دهنده کلنی در هر میلی­لیتر بر پایه جذب نوری: به­منظور تلقیح یکسان ماده تلقیح در محیط­های کشت مورد بررسی، ابتدا از باکتری باسیلوس AGh1 در محیط کشت لوریا-برتانی (Luria-Bertani) آگار کشت خطی شبانه تهیه و یک کلنی در محیط کشت لوریا-برتانی براث با حجم 20 میلی­لیتر در فالکون با ظرفیت اسمی 50 میلی­لیتر تلقیح شد. بلافاصله پس از تلقیح و سپس هر 2 ساعت یکبار جذب نوری در طول موج 600 نانومتر و چگالی سلولی با روش شمارش کلنی با تکنیک پور پلیت انجام شد. شرایط کشت دمای 37 درجه سانتی­گراد با سرعت شیکر 150 دور در دقیقه (RPM) بود. با توجه به معادله به دست آمده، هنگامی­که جذب نوری برابر با ضریبی از 108 واحد تشکیل دهنده کلنی در هر میلی­لیتر (CFU mL-1)( Colony Forming Unit per milliliter) بود، به میزان 1 درصد حجمی/حجمی در محیط­های کشت مورد بررسی تلقیح می­شد.

بررسی امکان استفاده

باکتری از پسماندهای کشاورزی به عنوان ماده اولیه: سبوس برنج، سبوس گندم و کاه برنج به عنوان پسماندهای کشاورزی جهت امکان استفاده باکتری برای تولید اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز بررسی شدند. وجود عناصر ضروری موجود در محیط کشت مندل (18) برای تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز نیز ارزیابی شد(8).. بدین منظور هشت محیط کشت مختلف (جدول 1) با استفاده از کربوکسی متیل سلولز-سدیم (CMC-Na)( Sodium-carboxymethyl celluloseسبوس برنج، سبوس گندم، کاه برنج، ترکیبات پایه محیط کشت مندل و عناصر ضروری (جدول 2) تهیه شد. مقدار استفاده از CMC-Na به میزان 10 گرم در لیتر و مقدار استفاده از سبوس برنج، سبوس گندم و کاه برنج به میزان 25 گرم در لیتر بود. برای استفاده از سبوس­ها و کاه، ابتدا آنها را با استفاده از دستگاه آسیاب کن، آسیاب کرده و از الک با مش 50 (297/0 میلی­متر) عبور داده شدند. pH، دما، حجم محیط کشت و دور همزن در زمان بهینه­سازی به ترتیب برابر با 6، 37 درجه سانتی­گراد، 100 میلی­لیتر و 150 دور در دقیقه بودند. بررسی­ها­ در ارلن­مایر بافل­دار با ظرفیت اسمی 250 میلی­لیتر انجام می­شد. محیط­های کشت پس از تلقیح در دمای 37 درجه سانتی­گراد با 150 دور در دقیقه به مدت 48 ساعت انکوبه شدند. پس از گذشت زمان انکوباسیون، محیط­های کشت با ×g 5000 سانتریفیوژ شده و سنجش فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از سوپرناتانت انجام شد. محیط کشتی که بیشترین فعالیت آنزیمی در آن مشاهده شد برای بهینه­سازی تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز انتخاب شد.

 

 

جدول 1- ترکیبات پایه و عناصر ضروری محیط کشت مندل

ترکیبات پایه

عناصر ضروری

ردیف

ترکیب

مقدار (گرم در لیتر)

ردیف

ترکیب

مقدار (میلی­گرم در لیتر)

 

1

(NH4)2SO4

4/1

1

ZnSO4.7H2O

4/1

 

2

KH2PO4

2

2

CoCl2

2

 

3

CaCl2

3/0

3

FeSO4.7H2O

5

 

4

MgSO4.7H2O

3/0

4

MnSO4.H2O

56/1

 

5

Tween 80

3/0

 

 

 

 

جدول 2- محیط­های کشت مختلف ساخته شده برای بررسی امکان استفاده از پسماند شکاورزی و ضرورت وجود عناصر ضروری معرفی شده در محیط کشت مندل جهت تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز از باسیلوس سویه AGh1

شماره محیط کشت

مشخصات

1

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه CMC-Na و عناصر ضروری

2

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه CMC-Na

3

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه سبوس گندم و عناصر ضروری

4

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه سبوس گندم

5

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه سبوس برنج و عناصر ضروری

6

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه سبوس برنج

7

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه کاه برنج و عناصر ضروری

8

ترکیبات پایه محیط کشت مندل به همراه کاه برنج

 

بهینه­سازی محیط کشت با استفاده از آزمون­های آماری:  ابزارهای آماری نظیر پلکت-بورمن و سطح پاسخ (RSM)( Response Surface Methodology) به ترتیب برای مشخص کردن فاکتورهای اثرگذار و بهینه­سازی شرایط برای تولید متابولیت­ها از میکروارگانیسم­ها، به­طور گسترده­ استفاده می­شوند (29،16،2). بین آزمون­های آماری، استپ-سایزینگ برای مشخص کردن جهت اثر فاکتورها بر یکدیگر و دست­یابی سریع­تر و اقتصادی­تر به نقطه هدف با استفاده از اثر متقابل فاکتورها بر یکدیگر کاربرد دارد (5). برای بهینه­سازی محیط کشت از نسخه 18 نرم افزار مینی­تب استفاده شد. pH، دما، حجم محیط کشت و دور همزن در زمان بهینه­سازی به ترتیب برابر با 6، 37 درجه سانتی­گراد، 100 میلی­لیتر و 150 دور در دقیقه بودند. بررسی­ها در ارلن­مایر بافل­دار با ظرفیت اسمی 250 میلی­لیتر انجام ­شد. ابتدا جهت تعیین فاکتورهای اثرگذار بر تولید اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز سویه باسیلوس AGh1 از طراحی فاکتوریل با طراحی پلکت- برمن (Plackett-Burman) استفاده شد. پس از تعیین ضرایب اثر متقابل بین فاکتورهای اثرگذار، بهبود شرایط کشت با تکنیک استپ-سایزینگ انجام شد. بهینه­سازی نهایی با RSM انجام و صحت نتایج آزمون با استفاده از آزمون یک نمونه­ای t برای میانگین با شش تکرار بررسی شد. در این پژوهش میزان فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در فرآیند بهینه­سازی محیط کشت به عنوان شاخصی بر میزان تولید این آنزیم در نظر گرفته شد.

بررسی pH و دمای بهینه فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز: سویه باسیلوس AGh1 در محیط کشت بهینه در حجم 200 میلی­لیتر در دمای 37 درجه سانتی­گراد در ارلن­مایر بافل­دار با ظرفیت اسمی 500 میلی­لیتر و 150 دور در دقیقه کشت داده شد. نمونه­برداری در زمانی که بیشترین فعالیت آنزیمی در کشت میکروارگانسیم مشاهده شده بود، انجام شد. بررسی بهینه فعالیت آنزیمی در دمای 60 درجه سانتی­گراد در pHهای 4 الی 10 با فواصل 2/0 و بررسی دمای بهینه فعالیت در دمای 40 الی 90 با فواصل 5 درجه سانتی­گراد انجام شد.

بررسی فعالیت

بتا-گلوکوزیداز و بررسی فعالیت اثر بر فیلتر کاغذی: سویه باسیلوس AGh1 در محیط کشت بهینه در حجم 200 میلی­لیتر در دمای 37 درجه سانتی­گراد و 150 دور در دقیقه در ارلن­مایر بافل­دار با ظرفیت اسمی 500 میلی­لیتر کشت داده شد. نمونه­برداری در زمانی که بیشترین فعالیت آنزیمی در کشت میکروارگانسیم مشاهده شده بود، انجام شد. بررسی فعالیت بتا-گلوکوزیداز (β-glucosidase) و بررسی فعالیت اثر بر فیلتر کاغذی (FPase)( Filter paper assay) جهت سنجش قدرت تولید قند (12) در pH و دمای بهینه فعالیت اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز ارزیابی شدند.

نتایج

بررسی پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در pHهای مختلف: پایداری حرارتی فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز طی زمان­های صفر، 2، 4، 6 و 8 ساعت در دمای 60 درجه سانتی گراد در سیستم­ بافری مختص به pH های 6، 8 و 10 در شکل 1 نشان داده شده است. آنزیم در pH 6 در زمان­های 2، 4، 6 و 8 ساعت به ترتیب 89/3 ± 59/90، 73/3 ± 26/63، 52/5 ± 47 و 78/1 ± 18/13 درصد فعالیت خود را حفظ کرده بود. در pH 8 در زمان­های 2، 4 و 6 ساعت به ترتیب 57/2 ± 36/83، 16/4 ± 39/59 و 43/2 ± 36/26 درصد از فعالیت خود را حفظ کرده بود و در ساعت هشتم غیر فعال شده بود. در pH 10 در زمان­های 2، 4، 6 و 8 ساعت به ترتیب 58/13 ± 35/94، 6/10 ± 69/67، 14/2 ± 25/50 و 11/3 ± 76/20 درصد فعالیت خود را حفظ کرده بود. با توجه به نتایج، رفتار مقاومت حرارتی آنزیم در pHهای 6 و 10 بیشتر از مقاومت حرارتی در pH 8 بود.

 

شکل 1- پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در pH های 6، 8 و 10

 

 

بهینه­سازی محیط کشت:

رسم منحنی رگرسیون خطی واحد تشکیل دهنده کلنی در هر میلی­لیتر بر پایه جذب نوری: با استفاده از نرم افزار اکسل 2019 منحنی رگرسیون خطی واحد تشکیل دهنده کلنی در هر میلی­لیتر بر پایه جذب نوری در طول موج 600 نانومتر رسم و معادله مربوطه محاسبه شد (شکل 2). با توجه به منحنی مشخص شد هنگامی­که جذب نوری در طول موج 600 نانومتر بین 15/0 تا 37/0 بود، تعداد باکتری ضریبی از 108 واحد تشکیل دهنده کلنی در هر میلی­لیتر بود. از این رو جهت تلقیح یکسان باکتری در محیط­های کشت، هنگامی که جذب نوری در محیط کشت لوریا-برتانی براث بین دو عدد مذکور می­رسید، تلقیح به میزان 1 درصدحجمی/حجمی در محیط­های کشت مورد بررسی انجام می­شد.

بررسی امکان استفاده باکتری از سبوس برنج، سبوس گندم و کاه برنج در تولید آنزیم: با توجه به نتایج در شکل 3 مشخص شد که محیط کشت حاوی سبوس برنج و فاقد عناصر ضروری (محیط کشت شماره 6) نسبت به سایر محیط­های کشت تهیه شده فعالیت آنزیمی بالاتری داشت، به­طوریکه در ساعت 33 فرآیند تخمیر بیشترین فعالیت آنزیمی را در محیط کشت نشان داد. از این رو برای ادامه روند بهینه­سازی محیط کشت، سبوس برنج به عنوان منبع سلولزی انتخاب و عناصر ضروری از ترکیبات محیط کشت حذف شدند. برای بهینه­سازی محیط کشت از این مرحله به بعد نمونه­ها در ساعت 33 فرآیند تخمیر بررسی می­شدند.

تعیین فاکتورهای اثرگذار بر تولید آنزیم: بررسی­ها­ در آزمون پلکت- برمن با ضریب اطمینان 90 (Confidence level) نشان دهنده اثرگذاری معنی دار فاکتورهای سبوس برنج و عصاره مخمر بر میزان فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در محیط­ کشت بودند. جدول 3 نتایج مربوط به فعالیت آنزیم در محیط­های کشت طراحی شده در آزمون پلکت- برمن و شکل 4 نمودار پرتو (Pareto) حاصل از تحلیل داده­ها را نشان می­دهند.

 

 

 

شکل 2- منحنی رگرسیون خطی چگالی سلولی (واحد تشکیل دهنده کلنی در هر میلی­لیتر) بر پایه جذب نوری در طول موج 600 نانومتر

شکل 3- روند تعییرات فعالیت آنزیمی (میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر) در محیط­های کشت مورد بررسی طی 48 ساعت اول فرآیند

شکل 4- نمودار پرتو حاصل از تحلیل داده­ها در آزمون پلکت- برمن

 

بهینه سازی شرایط تولید آنزیم: برای بهبود شرایط آنزیم از تکنیک استپ-سایزینگ استفاده شد، به­طوریکه برای تعیین ضرایب دو فاکتور مؤثر بر تولید اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز یعنی سبوس برنج و عصاره مخمر و همچنین از بین بردن اثر بالقوه فاکتورهای غیر مؤثر بر ضرایب این دو فاکتور، آزمون طراحی فاکتوریل دو سطحی (2-Level Factorial Design) با 5 نقطه مرکزی (5 center points) با استفاده از نسخه 18 نرم افزار مینی­تب به­صورت مولد پیش فرض (Default generator) طراحی شد. مقادیر حد پایین و حد بالا برای سبوس برنج به ترتیب 5 و 5/12 گرم در لیتر، مقادیر حد پایین و حد بالا برای عصاره مخمر به ترتیب 3 و 6 گرم در لیتر و مقادیر سایر فاکتورها برابر با محیط کشتی بود که بیشترین فعالیت آنزیمی در آزمون پلکت- برمن دیده شده بود (محیط کشت شماره 15 در جدول 3). نتیجه طراحی آزمایش 9 محیط کشت بود که به همراه نتایج حاصل در جدول 4 آمده اند. نتایج فعالیت آنزیمی محیط­های کشت با ضریب اطمینان 95 و به­صورت دو طرفه تحلیل شدند. با توجه به تحلیل داده­ها، ضرایب برای سبوس برنج و عصاره مخمر به ترتیب برابر با 64/0 و 74/0 بود.

 

 

جدول 4- محیط­های کشت تهیه شده برای آزمون طراحی فاکتوریل دو سطحی (مقادیر به­صورت گرم در لیتر و واحد فعالیت آنزیمی در ستون نتایج میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر است.)

نتایج

عصاره مخمر

سبوس برنج

Blocks

CenterPt

RunOrder

StdOrder

68/3

6

5

1

1

1

3

48/0

3

5/12

1

1

2

2

98/2

3

5

1

1

3

1

45/4

5/4

75/8

1

0

4

5

76/4

5/4

75/8

1

0

5

8

74/5

6

5/12

1

1

6

4

12/4

5/4

75/8

1

0

7

6

26/4

5/4

75/8

1

0

8

9

34/4

5/4

75/8

1

0

9

7

 

 

از آنجاییکه که ضرایب برای سبوس برنج برابر با 64/0 و برای عصاره مخمر برابر با 74/0 بود، محاسبه ارزش­های کدگذاری شده (Coded value) جهت تهیه محیط­های کشت مختلف برای بهبود شرایط کشت به­صورت ذیل انجام شد:

با استفاده از فرمول ارزش کدگذاری شده مربوط به عصاره مخمر محاسبه شد:

 

(4)

بنابراین:

 

با استفاده از فرمول 5، متغیر کدگذاری (Coded variable) شده مربوط به عصاره مخمر محاسبه شد:

(5)

بنابراین:

با استفاده از فرمول استپ سایز مربوط به مقدار عصاره مخمر محاسبه شد:

(6)

بنابراین:

و در نهایت:                          4/1 استپ سایز مربوط به مقدار سبوس برنج

 

 

با توجه به نتایج حاصل از معادلات 3 الی 6، به ازای هر واحد از سبوس برنج، 4/1 واحد از عصاره مخمر تغییر کرد. از این رو محیط­های کشت جدول 5 ساخته شده و فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در آنها بررسی شد. با توجه به نتایج حاصل از 16 محیط کشت مختلف تهیه شده، مشخص شد که فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز توسط سویه باسیلوس AGh1 هنگامی­ بیشترین بازدهی را دارد که سبوس برنج به میزان 57 گرم در لیتر و عصاره مخمر به میزان 8/22 گرم در لیتر باشد. با توجه به اینکه مقدار به دست آمده عصاره مخمر عدد بالایی بود و این احتمال وجود داشت که طی استپ-سایزینگ فاکتور عصاره مخمر از حد بهینه عبور کرده باشد، فاکتور سبوس برنج به میزان 57 گرم در لیتر، ثابت و فاکتور عصاره مخمر در جهت معکوس استپ-سایزینگ تغییر داده شد تا اثر این تغییر بر میزان فعالیت اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز بررسی شود.

 

 

جدول 5- محیط­های کشت ساخته شده از روی استپ-سایزینگ و نتایج مربوطه (مقادیر به­صورت گرم در لیتر و واحد فعالیت آنزیمی در ستون نتایج میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر است.)

نتایج

سطوح فاکتورها

Step

واقعی

کدگذاری شده

عصاره مخمر

سبوس برنج

عصاره مخمر

سبوس برنج

15/5

6

5/12

0

0

مقادیر کنونی

29/5

4/7

25/16

925/0

8/0

1

38/5

8/8

20

85/1

6/1

2

43/5

2/10

75/23

775/2

4/2

3

57/5

6/11

27

7/3

4

4

68/5

13

75/30

625/4

6/5

5

87/5

4/14

5/34

55/5

2/7

6

95/5

8/15

25/8

475/6

8

7

18/6

2/17

42

5/7

8/8

8

27/6

6/18

75/45

425/8

6/9

9

39/6

20

5/49

931/9

4/10

10

54/6

4/21

25/53

275/10

2/11

11

71/6

8/22

57

2/11

12

12

62/6

2/24

75/60

125/12

8/12

13

52/6

6/25

5/64

05/13

6/13

14

34/6

27

25/68

975/13

4/14

15

 

بدین منظور، محیط­های کشت جدول 6 تهیه و فعالیت آنزیمی در آنها بررسی شد.

جدول 6- محیط­های کشت تهیه شده با ثابت نگه­داشتن سبوس برنج و تغییر در فاکتور عصاره مخمر (مقادیر به­صورت گرم در لیتر و واحد فعالیت آنزیمی در ستون نتایج میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر است).

ردیف

مقدار عصاره مخمر

میزان فعالیت

1

8/22

57/6

2

4/21

61/6

3

20

65/6

4

6/18

62/6

5

2/17

54/6

6

8/15

67/6

7

4/14

78/6

8

13

84/5

9

6/11

49/5

10

2/10

98/4

11

8/8

79/4

12

4/7

75/4

13

6

64/4

 

با توجه به داده­های جدول 6 مشخص شد که افزایش عصاره مخمر از 6 تا 4/14 گرم در لیتر در محیط کشت، افزایش فعالیت آنزیم را به همراه داشت. از این رو، محدوده بین حد پایین و حد بالا در آزمون RSM جهت بهینه­سازی تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز توسط سویه باسیلوس AGh1 به صورت ذیل در نظر گرفت شد:

مقادیر برای سبوس برنج:  25/53 و 75/60 گرم در لیتر

مقادیر برای عصاره مخمر: 13 و 8/15 گرم در لیتر

 بهینه­سازی محیط کشت جهت تولید آنزیم با استفاده از آزمون RSM : آزمون RSM با تکنیک طراحی مرکب مرکزی (CCD) (Central Composite Design) با دو فاکتور متغیر سبوس برنج با مقادیر به ترتیب حد پایین و حد بالا 25/53 و 75/60 گرم در لیتر و عصاره مخمر با مقادیر به ترتیب حد پایین و حد بالا 13 و 8/15 گرم در لیتر با استفاده از 18 نرم افزار مینی­تب طراحی شد. در این آزمون 13 محیط کشت توسط نرم افزار معرفی شد که در جدول 7 به همراه نتایج آمده اند. نتایج فعالیت آنزیمی محیط­های کشت طراحی شده با ضریب اطمینان 95 و به­صورت دو طرفه تحلیل شدند که حاکی از بی معنی بودن عدم برازش (Lack-of-fit) بود، در نتیجه بهینه­سازی پیش از مرحله RSM به اتمام رسیده بود. شکل 5 نمودارهای طرح کانتور (Contour plot) و طرح سطحی (Surface Plot) را مبنی بر اثر متقابل دو فاکتور سبوس برنج و عصاره مخمر بر میزان فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در محیط کشت نشان می­دهد. نمودار­ها نشان می دهند هنگامی که مقادیر دو فاکتور سبوس برنج و عصاره مخمر در حد بهینه باشند، آنزیم فعالیت بیشتر از 2/7 میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر خواهد داشت. از این رو شش محیط کشت با مقادیر میانگین (سبوس برنج برابر با 5/58 گرم در ­لیتر و عصاره مخمر برابر با 87/14 گرم در ­لیتر) تهیه و صحت نتایج آزمون با استفاده از آزمون یک نمونه­ای t برای میانگین بررسی شد که تحلیل نتایج مبنی بر صحت پیش­بینی نرم افزار بود. در نهایت فرمول محیط کشت بهینه شده شامل 4/1 گرم در لیتر (NH4)2SO4، 6/0 گرم در لیتر KH2PO4، 3/0 گرم در لیتر CaCl2، 3/0 گرم در لیتر MgSO4.7H2O، 4 گرم در لیتر پپتون، 87/14 گرم در لیتر عصاره مخمر، 8/58 گرم در لیتر سبوس برنج و 2/0 میلی­لیتر Tween 80 بود.

بررسی pH و دمای بهینه فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز : فعالیت اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز در pH 4 الی 10 با فواصل 2/0 در دمای 60 درجه سانتی­گراد انجام شد. نتایج بیانگر pH بهینه 6/5 برای فعالیت آنزیمی بود. همچنین فعالیت آنزیم در دمای 40 الی 90 با فواصل 5 درجه سانتی­گراد بررسی شد که نتایج بیانگر بهینه فعالیت در دمای 70 درجه سانتی­گراد بود (شکل 6). فعالیت آنزیم در pH و دمای بهینه برابر با 12/0 ± 10 میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر بود.

 

 

جدول 7- آزمون RSM طراحی شده با تکنیک CCD (مقادیر به­صورت گرم در لیتر و واحد فعالیت آنزیمی در ستون نتایج میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر است.)

StdOrder

RunOrder

PtType

Blocks

سبوس برنج

عصاره مخمر

فعالیت آنزیمی

8

1

1 -

1

57

3799/16

68/6

1

2

1

1

53

13

42/6

11

3

0

1

57

4/14

15/7

10

4

0

1

57

4/14

37/7

4

5

1

1

75/60

8/15

97/6

2

6

1

1

75/60

13

75/6

9

7

0

1

57

4/14

19/7

13

8

0

1

57

4/14

28/7

5

9

1 -

1

6967/51

4/14

51/6

7

10

1 -

1

57

4201/12

14/6

12

11

2

1

57

4/14

25/7

6

12

1 -

1

3033/62

4/14

85/6

3

13

1 -

1

25/53

8/15

78/6

ب)

الف)

 

 

                 

شکل 5- نمودار طرح کانتور (الف) و طرح سطحی (ب) بیانگر اثر متقابل دو فاکتور سبوس برنج و عصاره مخمر بر میزان فعالیت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز

 

سنجش فعالیت  های بتا-گلوکوزیدازی و بررسی فیلتر کاغذی: با سنجش فعالیت های بتا-گلوکوزیداز و بررسی فیلتر کاغذی در دمای 70 درجه سانتی­گراد و pH 6/5، مشخص شد که محلول حاصل از محیط کشت باکتری فعالیت بتاگلوکوزیداز برابر با 12/0 ± 16/4 میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر و فعالیت FPase برابر با 09 ± 45/2 میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر داشت.

بحث

مطالعات بسیاری در زمینه دست­یابی به آنزیم­های پایدار در دمای بالا از میکروارگانیسم­های ترموفیل یا ترموتولرنت انجام شده است. موزدا و همکاران دو سویه باسیلوس CH43 (Bacillus sp. CH43) و HR68 (Bacillus sp. HR68) مولد سلولاز را از چشمه­های آب­گرم زیمباوه جداسازی کردند. سلولاز حاصل از هر دو سویه pH بهینه فعالیت 5 الی 5/6 را داشتند. دمای بهینه فعالیت برای آنزیم حاصل از سویه باسیلوس HR68 برابر با 65 درجه سانتی­گراد و در مورد سویه باسیلوس  CH43 برابر با 70 درجه سانتی­گراد بود. آنزیم حاصل از سویه باسیلوس CH43 در دمای 50 درجه سانتی­گراد در بازه pH 6 الی 10 و حاصل از سویه باسیلوس HR68 در بازه 6 الی 8 فعالیت داشتند (13).

 

 

الف)

ب)

شکل 6 pH بهینه (الف) و دمای بهینه (درجه سانتی­گراد) (ب) فعالیت اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز (میکرومول در درقیقه در میلی­لیتر) حاصل از محیط کشت بهینه سویه باسیلوس AGh1

 

 

تای و همکاران سویه باکتریایی ژئوباسیلوس ترمولورانس T4 (Geobacillus thermoleovorans T4) را از پساب کارخانه نیشکر در تایوان جداسازی کردند که توانایی ترشح آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز پایدار در حرارات داشت، به­طوریکه در دمای 100 درجه سانتی­گراد و pH 7 بیش از 10 درصد از فعالیت اولیه خود را حفظ کرده بود (28). سوکوماران و همکاران در پژوهشی مروری به بررسی سلولازهای باکتریایی و نقش آنها در صنایع مختلف و همچنین بهترین شیوه تولید آنزیم سلولاز از آنها پرداخته و خاطرنشان کردند که تولید سلولازهای باکتریایی و استفاده از آنها در صنایع از نظر اقتصادی بسیار مقرون به صرفه است. در این پژوهش بهترین روش برای تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز از سویه­های باکتریایی، تخمیر غوطه ور (Submerged Fermentation) بیان شده است (27). ابراهیم و ال-دیوانی باکتری­های ترموفیل انوکسیباسیلوس فلاویترموس EFP1 (Anoxybacillus flavithermus EFP1 جئوباسیلوس ترمودنیتریفیکانس EFP2 (Geobacillus thermodenitrificans EFP2) و جئوباسیلوس استئاروترموفیلوس EHP3 (Geobacillus stearothermophilus EFP3) با قابلیت تجزیه CMC را از چشمه­های آب­گرم مصر جداسازی کردند. بهینه فعالیت آنزیم حاصل از این سویه­ها در دمای 75 درجه سانتی­گراد و pH 5/7 گزارش شده است (14). راستگی و همکاران سویه­هایی را از نمونه­های کمپوست جداسازی کردند که قادر به تجزیه CMC و سبوس بودند. از میان سویه­های جداسازی شده، سویه‌ی جئوباسیلوس WSUCF1 به دلیل دارا بودن بالاترین میزان تولید و فعالیّت سلولازی در محیط کشت مایع نسبت به دیگر سویه­ها، انتخاب و دمای بهینه برای فعالیّت آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از آن 70 درجه سانتی­گراد و pH بهینه آن را 5 گزارش کردند (24). پودوسوکورسکایا و همکاران به بررسی سویه‌ی ترموفیل فرویدوباکتریوم ریپایریوم (Fervidobacterium riparium) سلولولیتیک هوازی جداسازی شده از چشمه‌ی آب گرم پرداخته و دمای بهینه‌ی فعالیت آنزیم را 65 درجه سانتی­گراد گزارش شده کردند (22). گوآر و تیواری موفق به جداسازی و تولید اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز ترموفیل و قلیادوست از باکتری باسیلوس والیسمورتیس RG-07 (Bacillus vallismortis RG-07) شدند. آنها دما و pH بهینه برای فعالیّت آنزیم را به ترتیب 65 درجه سانتی­گراد و 7 گزارش کردند. این آنزیم 75 درصد فعالیّتش را در دمای 95 درجه سانتی­گراد با pH 9 حفظ می‌کرد (10). عزیزی و همکاران طی پژوهشی موفق به جداسازی باکتری­های سلولوتیک از چشمه­های آب گرم دهلران در ایلام شدند. در این پژوهش به غربالگری میکروارگانیسم­های تولید کننده سلولاز پرداخته شد، سپس محیط کشت باکتری که از قدرت بالاتر سلولوتیک برخوردار بود را بهینه کرده و پس از شناسایی سویه جداسازی شده را  ایزوپتریکولا واریابیلیس IDAH9 (Isoptericola variabilis IDAH9) نامگذاری کردند. این میکروارگانیسم بیشترین میزان تولید سلولاز را در غلظت 9 گرم در لیتر CMC، 6/5 گرم در لیتر آمونیوم سولفات، 6/0 درصد توئین 80 و 2 درصد سوکروز داشت. آنزیم تولیدی پایداری 1 ساعته در دمای 65 درجه سانتی­گراد داشت (4). آزادیان و همکاران سویه باسیلوس لچینیفورمیس AMF-07 (Bacillus licheniformis) را از یکی از چشمه­های آب گرم استان کرمان جداسازی کرند. اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از این سویه در رنج وسیع دما و pH به ترتیب 40 تا 80 درجه سانتی گراد و 6 الی 10 فعال بوده و دما و pH بهینه به ترتیب 70 درجه سانتی­گراد و 9 داشت (3). شاجهان و همکاران باکتری ترموفیل باسیلوس لچینیفورمیس تولید کننده آنزیم سلولاز را از یکی از چشمه­های آب­گرم در هند جداسازی کرده و پس از بهینه­سازی محیط کشت با RSM میزان فعالیت آنزیم سلولاز را تا 3 برابر افزایش دادند. مقدار مواد مورد بررسی در محیط کشت پس از بهینه­سازی شامل 21/19 گرم در لیتر CMC، 06/25 میلی­گرم در لیتر CaCl2.6H2O و 96/2 میلی­لیتر در لیتر Tween 20 بودند (26). ایرفان و همکاران سویه باکتریایی باسیلوس آمیلولیکوئیفشیانس AK9 (Bacillus amyloliquefaciens) را از چشمه آب گرم تاتاپانی (Tatta Pani) در کشمیر پاکستان جداسازی کردند که اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از این سویه در رنج وسیع دما و pH به ترتیب 50 تا 70 درجه سانتی گراد و 3 الی 6 فعال بوده و حداکثر پایداری آن در دما و pH بهینه برای فعالیت آنزیم به ترتیب 50 درجه سانتی­گراد و 5 بود (15). در این پژوهش پایداری حرارتی آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از سویه باکتریایی باسیلوس AGh1 که از قبل جداسازی شده بود در دمای 60 درجه سانتی­گراد در pHهای 6، 8 و 10 ارزیابی شد. آنزیم در pH 6 در زمان­های 2، 4، 6 و 8 ساعت به ترتیب 89/3 ± 59/90، 73/3 ± 26/63، 52/5 ± 47 و 78/1 ± 18/13 درصد فعالیت خود را حفظ کرده بود. در pH 8 در زمان­های 2، 4 و 6 ساعت به ترتیب 57/2 ± 36/83، 16/4 ± 39/59 و 43/2 ± 36/26 درصد از فعالیت خود را حفظ کرده بود. در pH 10 در زمان­های 2، 4، 6 و 8 ساعت به ترتیب 58/13 ± 35/94، 6/10 ± 69/67، 14/2 ± 25/50 و 11/3 ± 76/20 درصد فعالیت خود را حفظ کرده بود. نتایج حاکی از ان است که آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از سویه باکتریایی باسیلوس AGh1 علاوه بر پایداری حرارتی بالا، توان فعالیت در محدوده وسیع pH داشت. با توجه به نتایج این پژوهش و مطالعه قبلی که آنزیم در pH 4 در زمان­های 2 و 4 ساعت به ترتیب 4/5 ± 69/86، 75/3 ± 71 درصد فعالیت خود را حفظ کرده بود (8)، به نظر می­رسد سویه حاضر قابلیت عملکردی مناسبی در طیف وسیع pH داشت باشد.

توجه روزافزونی برای استفاده از ضایعات و پسماندهای کشاورزی به عنوان منابع اولیه بالقوه برای کشت میکروارگانیسم­ها و تولید ترکیبات با ارزش افزوده بالا وجود دارد (1، 23). سلولاز‌ها کمپلکسی آنزیمی از سه گروه هستند که به­طور هم‌افزایی عمل کرده و می‌توانند پیوندهای گلوکوزیدی ß(1→4) را هیدرولیز نمایند. این گروه­ها شامل بتا 1و4- اندوگلوکاناز، سلوبیوهیدرولاز و بتا گلوکوزیداز هستند (30). در این پژوهش امکان استفاده از سبوس برنج، سبوس گندم و کاه برنج به عنوان پسماند صنایع کشاورزی و ماده اولیه ارزان جهت تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز از سویه باسیلوس AGh1 بررسی شد. با توجه به نتایج مشخص شد که فعالیت آنزیم در محیط­های کشت حاوی سبوس برنج، چه در حضور عناصر ضروری معرفی شده در محیط کشت مندل (18) به عنوان محیط کشت پر کاربرد در جداسازی میکروارگانیسم­های تجزیه کننده سلولاز و چه فاقد این عناصر ضروری، نسبت به سایر محیط­های کشت تهیه شده فعالیت آنزیمی بالاتری داشت (محیط­های کشت شماره 5 و 6 در جدول 2). بین این دو محیط، محیط کشت فاقد عناصر ضروری دو مزیت جهت انتخاب برای ادامه روند پژوهش داشت، اول اینکه بیشترین فعالیت آنزیمی در محیط کشت زودتر مشاهده شده بود و دیگری اینکه نیازی به عناصر ضروری به عنوان ماده اولیه برای فرآیند تخمیر نبود.

در این پژوهش بهینه­سازی محیط کشت جهت تولید اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز حاصل از سویه باسیلوس AGh1 انجام و مشخص شد که فاکتورهای سبوس برنج و عصاره مخمر اثر معنی­دار بر تولید آنزیم اندو-4،1-بتا-دی-گلوکاناز از سویه باسیلوس AGh1 دارند. به­طوریکه پس از اتمام مراحل بهینه­سازی محیط کشت فعالیت آنزیم بیشتر از 2/7 میکرومول در دقیقه در میلی­لیتر شد که 3/1 برابر بیشتر از فعالیت در محیط کشت اولیه حاوی سبوس برنج بود. با توجه به نتایج این پژوهش می­توان استنباط کرد که آنزیم معرفی شده به عنوان آنزیمی پایدار در دمای 60 درجه سانتی گراد و محدوده وسیع pH (4 الی 10)، با بهینه دمای 70 درجه سانتی­گراد و بهینه pH برابر با 6/5، قابلیت توسعه مطالعات و به­کارگیری دارد.

سپاسگزاری

از مرکز مطالعات و همکاریهای علمی بین المللی به خاطر حمایت از این مطالعه  در قالب طرح  مصوب شماره 4000152 ، سپاسگزاری می گردد.

30- تقی زاده ن، فارسی م، پاریزی ع پ، طریقی س. تعیین فعالیت سلولازی آکتینومیست‌های گرما‌دوست موجود در کمپوست قارچ خوراکی به روش ارزیابی با کاغذ صافی. پژوهش­های سلولی و مولکولی. 1393؛27 : 26 34.
 
2. Adinarayana A, Ellaiah P, Srinivasulu B, Devi RB, Adinarayana G. Response surface methodological approach to optimize the nutritional parameters for neomycin production by Streptomyces marinensis under solid-state fermentation. Process Biochemistry. 2003;38:1565-72.
3. Azadian F, Dalfard AB, Shoushtari AN, Hassanshahian M. Purification and biochemical properties of a thermostable, haloalkaline cellulase from Bacillus licheniformis AMF-07 and its application for hydrolysis of different cellulosic substrates to bioethanol production. Molecular Biology Research Communications. 2016;5:143-55.
4. Azizi M, Hemmat J, Seifati SM, Torktaz I, Karimi S. Characterization of a thermostable endoglucanase produced by Isoptericola variabilis sp. IDAH9. Brazilian Journal of Microbiology. 2015;46:1225-34.
5. Chen H, Niu J, Qin T, Wang L, Shu G. Optimization of the medium for Lactobacillus acidophilus by Plackett-Burman and steepest ascent experiment. ACTA Scientiarum. 2015;14:227–32.
6. Dahpahlevan S, Khara J, Mousivand M, Hashemi M. Determination and modeling the optimum conditions of beta glucanase Bacillus subtilis B5d activity with potential used as feed additive. Biological Journal of Microorganism. 2016;17:1-14.
7. Demirjian DC, Morı́s-Varas F, Cassidy CS. Enzymes from extremophiles. Current Opinion in Chemical Biology. 2001;5(2):144-51.
8. Diba H, Hemmat J, Vaez M, Amoozegar MA. Screening of Bacteria Producing Acid-stable and Thermostable Endo-1, 4-β-Glucanase from Hot Springs in the North and Northwest of Iran. Advanced Researches in Microbial Metabolites and Technology. 2018;1:23-30.
9. Ghose TK. Measurement of Cellulase Activities. Pure and Applied Chemistry. 1987;59:257-68.
10. Guar R, Tiwari S. Isolation, production, purification and characterization of an organic-solvent-thermostable alkalophilic cellulase from Bacillus vallismortis RG-07. BMC Biotechnology. 2015;15.
11. Guerriero G, Hausman JG, Strauss J, Ertan H, Siddiqui KS. Lignocellulosic biomass: Biosynthesis, degradation, and industrial utilization. Engineering in Life Sciences. 2016;16:1-16.
12. Han N, Li Z, Zhang X, Yu W, Chen X, Wang D, et al. Synthesis and characterization of cellulose-g-polyoxyethylene (2) hexadecyl ether solid–solid phase change materials. Cellulose. 2016.
13. Heinze T. Cellulose: Structure and Properties. Advances in Polymer Science. 2016;271:1-52.
14. Ibrahim ASS, El-diwany A. Isolation and Identification of New Cellulases Producing Thermophilic Bacteria from an Egyptian Hot Spring and Some Properties of the Crude Enzyme. Australian Journal of Basic and Applied Sciences. 2007;1: 473-8.
15. Irfan M, Tayyab A, Hasan F, Khan S, Badshah M, Shah AA. Production and Characterization of Organic Solvent-Tolerant Cellulase from Bacillus amyloliquefaciens AK9 Isolated from Hot Spring. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2017;182:1390-402.
16. Kanmani P, Karthik S, Aravind J, Kumareson K. Research Article The Use of Response Surface Methodology as a Statistical Tool for Media Optimization in Lipase  Production from the Dairy Effluent Isolate Fusarium solani. ISRN Biotechnology. 2013:Article ID 528708.
17. Lentzen G, Schwarz T. Extremolytes: natural compounds from extremophiles for versatile applications. Applied Microbiology and Biotechnology. 2006;72:623-34.
18. Mandels M, Weber J. The production of cellulases. Advances in Chemistry. 1969;95:391-414.
19. Mawazda C, Hatto-Kaul R, Zvauya R, Mattiasson B. Purification and characterization of cellulases produced by two Bacillus strains. Journal of Biotechnology. 2000;13:177-87.
20. Niehaus F, Bertoldo C, Mahler M, Antranikian G. Extremophiles as a source of novel enzymes for industrial application. Applied Microbiology and Biotechnology. 1999;51:711-29.
21. Nouri H, Sajadi T, Azin M. Comparative production of cellulases by mutants of Trichoderma parceramosume PTCC5140. Biological Journal of Microorganism. 2017;22:1-13.
22. Podosokorskaya OA, Merkel AY, Kolganova TV, Chernyh NA, Miroshnichenko ML, Bonch-Osmolovskaya EA, et al. Fervidobacterium riparium sp. nov., a thermophilic anaerobic cellulolytic bacterium isolated from a hot spring. International journal of systematic and evolutionary microbiology. 2011;61:2697-701.
23. Rasouli A, Aghaei SS, Zarfar M. Bio-production of Single-cell Oil by Rhodococcus Erythropolis PTCC 1767 Bacterial using Low-cost Carbon Sources. Biological Journal of Microorganism,. 2020;35:71-85.
24. Rastogi G, Bhalla A, Adhikari A, Bischoff KM, Hughes SR, Christopher LP, et al. Characterization of thermostable cellulases produced by Bacillus and Geobacillus strains. Bioresource technology. 2010;101:8798-806.
25. Schiraldi C, De-Rosa M. The production of biocatalysts and biomolecules from extremophiles. TRENDS in Biotechnology. 2002;20(12):515-21.
26. Shajahan S, Moorthy IG, Sivakumar N, Selvakumar G. Statistical modeling and optimization of cellulase production by Bacillus licheniformis NCIM 5556 isolated from the hot spring, Maharashtra, India. Journal of King Saud University- Science. 2016.
27. Sukumaran RK, Singhania RR, Pandey A. Microbial cellulase-Production, application and challenges. Journal of Scientific and Industrial Research. 2005;64:832-44.
28. Tai H, M., YIn L, Chen WC, Jiang ST. Overexpression of Escherichia coli Phytase in Pichia pastoris and Its Biochemical Properties. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2013;51:6007–15.
29. Tirawongsaroj P, Sriptang R, Harnpicharnchai P, Thongaram T, Champreda V, Tanapongpipat S, et al. Novel thermophilic and thermostable lipolytic enzymes from a Thailand hot spring metagenomic library. Journal of Biotechnology. 2008;133:42-9.
 
دوره 38، شماره 2
تابستان 1404
صفحه 127-142

  • تاریخ دریافت 04 مرداد 1402
  • تاریخ بازنگری 16 شهریور 1402
  • تاریخ پذیرش 19 آذر 1402