2024-03-28T18:00:09Z
https://cell.ijbio.ir/?_action=export&rf=summon&issue=130
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
جداسازی، توالی یابی و بررسی بیوانفورماتیکی عناصر تنظیمی ناحیه پروموتوری ژن C3 در ماهی قزل آلا(Salmo salar)
علی محمد
احدی
سمیه
خاتمی
هدا
آیت
سیستم کمپلمان از اجزاء اصلی سیستم دفاعی بدن بسیاری از موجودات میباشد. وجود این سیستم در موجودات متعددی تایید شده است اما در مورد مکانیسم های تنظیم بیان آن در سطح ژنومی برخی از موجودات اطلاعاتی وجود ندارد. در این مطالعه به بررسی ناحیه بالادستی ژن C3 از ماهی قزل آلا پرداخته ایم. بافتهای مختلف ماهی تهیه و DNA با روش تغییر یافته فنل-کلروفرم استخراج شد. به کمک پرایمرهای دجنره طراحی شده برای ناحیه بالادستی این ژن که بر اساس اطلاعات سایر گونه ها انجام شد، با واکنش زنجیره پلیمراز غیر کلاسیک، قطعه هدف تکثیر و تعیین توالی و در نهایت در بانک اطلاعات ژنومی ثبت شد. در مرحله بعد به کمک سرورها و نرم افزارهای مختلف آناتومی کامل توالی بدست آمده از نظر وجود عناصر تنظیمی بررسی گردید. توالی ناحیه پروموتوری ژن C3 ماهی قزل آلا در بانک ژنومی NCBI با شماره دستیابی JQ799884.1 به ثبت رسید. وجود توالیهای حفاظت شده جعبه TATA و همچنین عناصر پاسخگو به فاکتورهایی مانند abaA ، C/EBP،CTCF، IL-6، GR و PPAR ردگیری شد، هرچند وجود نواحی پاسخگو مانند Sp1، CRE، ERE تایید نشد. نتایج این مطالعه علاوه بر تایید وجود سیستم نسبتا تکامل یافته ای از تنظیم روی سیستم کمپلمان در ماهی های استخوانی میتواند از قدیمی بودن این سیستم حمایت نماید. این مطالعه اولین گزارش دقیق از عناصر تنظیمی کنترل کننده بیان ژنی از سیستم کمپلمان است و شاید موید نقشهای جدیدی مانند دخالت مشتقات کمپلمان در تکوین اولیه جنین باشد که در مطالعاتی مطرح شده است.
سیستم کپلمان
عناصرتنظیم ژنی
ناحیه پروموتوری
2018
09
23
342
352
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
بررسی ویژگی های ساختاری و تکوینی دانه گرده، تخمک، رویان و دانه در گونه Ebenus stellata
نیره
تنعمی
پریسا
جنوبی
عبدالکریم
چهرگانی راد
احمد
مجد
مسعود
رنجبر
ویژگی های ساختاری و تکوینی اندام های زایشی در گیاه Boiss. Ebenus stellata (Fabaceae)، که تنها گونه جنس Ebenus L. در ایران می باشد، توسط میکروسکوپهای نوری، فلورسانس و پلاریزان و با استفاده از تکنیک های مختلف رنگ آمیزی برای نخستین بار بررسی شد. در این گیاه مادگی تک برچه، تک تخمکی، فاقد پایک و دارای کرک های تار ابریشمی انبوه با برجستگی های انگشت مانند است. تخمک خمیده، دوپوششی، پرخورش و دارای لایه آندوتلیوم می باشد. حاصل تقسیم مگاسپوروسیت یک تتراد T شکل است. سرانجام تکوین مگاسپور شالازی به تشکیل یک کیسه رویانی با الگوی پلی گونوم منجر می شود. در مجاورت دستگاه تخمزا هسته های قطبی مجزا، پس از لقاح تخمزا با تاخیر زمانی قابل توجه به یکدیگر ملحق می شوند. در کیسه رویانی این گونه بافت های تخصصی هیپوستاز، پوستامنت و درپوش فنجانی تشکیل می شود. در دانه یک لایه سلول ماکرواسکلرید شعاعی کشیده، لایه نردبانی دو لایه، اثر تراکئید با غلافی از سلول های پارانشیمی که حاوی ترکیبات فنلی می باشند، دیده می شود. در اندام زایشی نر، بساک ها چهار کیسه گرده ای و تکوین دیواره از نوع دولپه ای می باشند که متشکل از چهار لایه شامل: اپیدرم، لایه مکانیکی، یک لایه میانی و تاپی ترشحی تک هسته ای است. تکوین گرده ها در کیسه های گرده یک بساک همزمان است و آرایش میکروسپورها در کالوز غالبا از نوع تتراهدرال می باشد. در زمان شکوفایی بساک ضخامت لایه مکانیکی افزایش می یابد. گرده های بالغ بیضی شکل، سه شیاری و دو سلولی هستند.
کیسه رویانی
بساک
دانه
پروانه آسایان
Ebenus stellata
2018
09
23
278
291
https://cell.ijbio.ir/article_1108_6530d5e03e7e47a1bde764dae531806a.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
بررسی اثر نانوکورکومین دندروزومی بر بیان ژن های POU5F1 و NANOG در رده سلولیCaco-2 سرطان کولون
مرضیه
چوری
سهراب
بوذرپور
عبدالوهاب
مرادی
عیسی
جرجانی
سرطان کولون چهارمین سرطان شایع میباشد. با توجه به شیوع بسیار بالای سرطان و مرگ ناشی از آن، اهمیت پرداختن به پژوهشهای مرتبط با داروها از جمله ترکیبات موثر در پیشگیری، درمان و جلوگیری از عود و بازگشت سرطان کاملا واضح و آشکار است. کورکومین رنگدانه زرد طبیعی جداشده از ریزوم زردچوبه میباشد. کورکومین یک کاندید جدید برای درمان سرطان محسوب میشود اما دسترسی زیستی و حلالیت کم، استفاده از آن را با محدودیت روبرو کرده است. بدین منظور اثر نانوحامل دندروزومی در افزایش اثر کورکومین بر روی رده سلولی سرطانی کولون (Caco-2) مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور IC50 با استفاده از روش MTT محاسبه گردید و همچنین تاثیر نانوکورکومین دندروزومی بر بیان ژنهای POU5F1 و NANOG به وسیله روش Real Time PCR بررسی شد. نتایج ما نشان داد که نانوکورکومین دندروزومی به صورت وابسته به زمان و غلظت، رشد سلولی را کاهش داده، علاوه بر این بیان ژنهای POU5F1و NANOG را در رده سلولی Caco-2 سرطان کولون کاهش میدهد. بهطور کلی نتایج نشان داد که نانوکورکومین دندروزومی میتواند به طور مؤثر در درمان سرطان کولون با کاهش بیان ژنهای دخیل در تکثیر نامحدود سلولها دخیل باشد.
نانوکورکومین دندروزومی
سرطان کولون
POU5F1
NANOG
2018
09
23
292
301
https://cell.ijbio.ir/article_1314_66dbd0732696484c8a35aff9dd124c2a.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
اثر روغن زیتون بر تولید اسیدهای چرب امگا در مخمر یارروویا لیپولیتیکا
فرشاد
درویشی
ناهیده
سلمانی
میکروارگانیسمهای روغنی بیش از 20 درصد وزن خشک خودشان چربی تولید میکنند. اسیدهای چرب امگا، به عنوان اسیدهای چرب ضروری برای تغذیه انسان، توسط این میکروارگانیسمها تولید میشود. بررسی اثر روغن زیتون بر روی تولید اسیدهای چرب امگا توسط مخمر یارروویا لیپولیتیکا هدف این تحقیق بود. مخمر در محیط کشت حاوی روغن زیتون کشت داده شد و سپس برای شمارش تعداد سلولها و استخراج چربی میکربی به مدت چهار روز نمونه برداری شد. بیشترین مقدار چربی و وزن خشک به ترتیب با مقدار 32/5 و 2/10 گرم در لیتر پس از سه روز به دست آمد. نتایج تجزیه و تحلیل نیم رخ اسیدهای چرب نشان داد که هر دو اسیدهای چرب اشباع و غیراشباع در چربی میکربی حاصل وجود دارند. حدود 62/2 گرم در لیتر اسید چرب امگا تولید شد که به ترتیب میزان اسید اولئیک، اسید لینولئیک و اسید گوندئیک 37/2 ، 2/0 و 05/0 گرم در لیتر بودند. اسیدهای چرب غیر اشباع امگا 6 (اسید لینولئیک) و 9 (اسید اولئیک و اسید گوندوئیک) تولید شده توسط مخمر در محیط حاوی روغن زیتون را میتوان در محصولات دارویی و تغذیهای به کار رود.
میکروارگانیسم روغنی
چربی میکروبی
نیم رخ اسیدچرب
اسید چرب اشباع
اسید چرب غیر اشباع
2018
09
23
302
311
https://cell.ijbio.ir/article_1327_f294db437f5e4f9aa6ffafc1e455eda9.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
تجزیه و تحلیل آماری پپتیدهای ضدسرطان گیاهی با استفاده از محیطR
لیلا
زرندی میاندوآب
الهه
زاده حسینقلی
به رغم پیشرفتهای چشمگیر در زمینه درمان سرطان، علاقه به طراحی داروهای جدید افزایش یافتهاست. برخی از پپتیدهای گیاهی طیف گستردهای از فعالیتهای سیتوتوکسیک را در برابر سلولهای سرطانی نشان میدهند. هدف این مطالعه تجزیه و تحلیل آماری پپتیدهای ضدسرطان گیاهی شناخته شده و همچنین یافتن مهمترین ویژگیهای مشترک بین آنها بود. در این راستا لیستی از پپتیدهای ضدسرطان گیاهی موجود در پایگاه داده (The Antimicrobial Peptide Database) تهیه و اطلاعات مربوط به هر پپتید استخراج شد. آنالیزهای آماری در محیط نرمافزار R Studio صورت گرفت. نتایج بیانگر آن بود که 55 مورد ثبت شده اغلب از نظر تاکسونومی متعلق به رده Malpighiales بودند. تقریباً 44 درصد پپتیدها طولی در بازه 25 الی 30 اسیدآمینه داشتند. هیستیدین و متیونین کمترین فراوانی را در بین اسیدآمینههای تشکیلدهنده پپتیدها داشتند. سیستئین، سرین و گلیسین فراوانترین اسیدآمینهها بودند. 91 درصد پپتیدها کمتر از 10 اسیدآمینه اسیدی و 71 درصد پپتیدها کمتر از 10 اسیدآمینه بازی داشتند. شارژ خالص 76 درصد پپتیدها بین 2- الی 2 بود. 64 درصد پپتیدها اندکس بومن کمتر از 1 داشتند. پایین بودن این اندکس نشانگر هیدروفوبیسیتی بالای این پپتیدها و افزایش احتمال برهمکنش آنها با سایر پروتیینهاست. همچنین مهمترین ساختار سه بعدی شناخته شده برای پپتیدهای ضدسرطان گیاهی حضور 3 پل دیسولفیدی بود. بنابراین تولیدکنندگان و طراحان دارو میتوانند با استفاده از این ویژگیها که از آنالیزهای آماری پیشرفته استخراج میشوند، نسبت به سنتز یا کشف داروهای موثر جدید با اثرات جانبی کمتر اقدام نمایند.
واژه های کلیدی: پپتیدهای ضدسرطان گیاهی
تجزیه و تحلیل آماری
محیط نرم افزار R Studio
2018
09
23
312
324
https://cell.ijbio.ir/article_1451_0f879bd0703c681e607fdd18747d1229.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
جداسازی، همسانه سازی و خاموشی موقت ژن BBE1 با استفاده از تکنیک خاموشی ژن القا شده توسط ویروس (VIGS) در ژنوتیپ ایرانی گیاه شقایق .Papaver somniferum L
سید محسن
سهرابی
احمد
اسماعیلی
فرهاد
نظریان فیروزآبادی
کامران
سمیعی
گیاه دارویی شقایق (Papaver somniferum L.) یکی از قدیمی ترین گیاهان دارویی جهان است و به عنوان تنها منبع تجاری برای تولید مسکنهای مهم دارویی و مشتقات نیمه سنتزی مانند اکسی کدون و نالترکسون مطرح است. چندین آلکالوئید بنزیل ایزوکوئینولینی دیگر با ویژگیهای بالقوه دارویی از جمله پاپاورین، نوسکاپین و سانگوینارین نیز توسط این گیاه تولید میشود. ژن BBE1 یکی از ژنهای کلیدی در بیوسنتز آلکالوئیدهای بنزیل ایزوکوئینولینی در گیاه شقایق بوده و اولین مرحله واکنش را در تولید آلکالوئیدهای نوسکاپین و سانگوینارین کاتالیز میکند. در این پژوهش، ابتدا توالی کامل کد کننده ژن BBE1 با استفاده از آغازگرهای اختصاصی از گیاه شقایق جداسازی شد. پس از جداسازی ژن مورد نظر، بخشی از آن به عنوان قطعه هدف خاموشی ژن انتخاب و سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی در ناقل پلاسمیدی pTZ57R/T همسانه سازی و مورد تعیین توالی قرار گرفت. در مرحله بعد این قطعه خاموشی ژن BBE1 به ناقلهای ویروس جغجغهای توتون (pTRV) وارد و سازههای مختلف pTRV2-BBE1، pTRV2-Empty حاصل به همراه سازه کمکی pTRV1 بواسطه آگروباکتریوم به برگهای گیاهان 3 تا 5 برگی تزریق و منتقل شد. نتایج جداسازی، وجود توالی 1608 جفت بازی را برای ژن BBE1 نشان داد. آنالیز PCR با پرایمرهای ژن CP وجود رونوشتهای این ژن را در گیاهان تراریخت شده نشان داد. آنالیز Real-time PCR میزان خاموشی و کاهش 73 درصدی رونوشتهای ژن BBE1 را در گیاهان تراریخت در مقایسه با گیاهان شاهد نشان داد.
شقایق
خاموشی ژن
ناقل pTRV
واکنش Real-time PCR
2018
09
23
325
336
https://cell.ijbio.ir/article_1222_18c4bdc1e24e6498749d959c50090a30.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
بررسی کشت سلولهای بنیادی اسپرم ساز در شرایط چسبنده و غیر چسبنده
حسین
عزیزی
عبدالحسین
شاهوردی
اباصلت
حسین زاده کلاگر
سلولهای بنیادی اسپرم ساز سلولهایی هستند که در غشاء پایه لوله های اسپرم ساز قرار گرفته و قادر به تولید اسپرم در طول حیات مردان می-باشند. مطالعات مختلف آزمایشگاهی نشان داد این سلولها بعد از جداسازی از بافت بیضه، تحت شرایط های خاص قادر به کشت هستند. در این مطالعه سلولهای بیضه موش های نر5-7 روزه نژاد NMRIپس از تیمار با آنزیمهای هضم کننده کلاژناز تیپIV، DNAse و دیسپاز، جداسازی شدند. سپس تعداد تقریبی106 سلول در محیط های حاوی فاکتورهای رشد با شرایط کشت چسبنده، روی فیبروبلاست جنینی موش و کشت غیر چسبنده، روی آگارز 1 درصد، کشت داده شدند. نتایج نشان داد سلولهای بیضوی کشت شده در شرایط غیرچسبنده قادر به تشکیل کلنیهایی بوده که همانند کلنیهای سلولهای بنیادی اسپرم ساز تشکیل شده در شرایط کشت چسبنده، مارکرهای سلولهای جنسی را بیان می-کنند. مطالعه میکروسکوپ الکترونی کلنیها نشان داد، هر دو نوع کلنی همانند سلولهای اسپرم ساز واقع در غشاء پایه لولههای اسپرم ساز دارای هسته بزرگ اما سیتوپلاسم کوچک میباشند. رنگآمیزی ایمونوفلورسانس وجود کلنیهای β1-Integrin، α6-Integrin و Oct4 مثبت را تایید کرد. آنالیزهای Real-time PCR نیز تفاوت معنیداری در بیان ژنهای سلولهای جنسی این کلنیها با سلول سوماتیکی نشان داد. از طرف دیگر افزایش بیان Ki67 در هر دو نوع کلنی با استفاده از بررسی ایمونوسیتوشیمی مشاهده شد که بیانگر خاصیت تکثیرپذیری این قبیل از سلول-ها است. این نتایج نشان میدهد سیستم کشت غیر چسبنده میتواند بعنوان یک روش جدید برای کشت کوتاه مدت سلولهای جنسی مشتق شده از بیضه مورد توجه محققین در تحقیقات بعدی قرار گیرد.
سلولهای بنیادی اسپرم ساز
کشت سلول جنسی
بیان ژن های جنسی
آنتی ژن Ki67
2018
09
23
337
347
https://cell.ijbio.ir/article_1283_228f7d89b2975498350436eb7aeeaa29.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
بررسی اثر تیموکوئینون بر بیان ژنهای iNos و Cox-1 در سلولهای بنیادی مزانشیمی مشتق شده از مغز استخوان موش
الهام
علیمرادی
سجاد
سی سخت نژاد
حسن
اکرمی
تیموکوئینون ماده فعال برخی از گیاهان دارویی میباشد. علیرغم مطالعات گسترده در زمینه اثرات زیستی و درمانی تیموکوئینون، هیچ گونه پژوهشی در رابطه با اثر این ترکیب بر سلولهای بنیادی انجام نشده است. بنابراین، هدف از این مطالعه بررسی اثر تیموکوئینون بر بیان ژنهای iNos و Cox-1 دخیل در پتانسیل تنظیمکنندگی سیستم ایمنی سلولهای بنیادی مزانشیمی (MSCs) مشتق شده از مغز استخوان موش در سطح رونویسی میباشد. سلولهای MSC از مغز استخوان موشهای نژاد NMRI جدا شدند و پتانسیل بنیادینگی آنها توسط تستهای تمایزی به سمت سلولهای استخوان و چربی تایید شد. نتایج حاصل از آزمون MTT نشان داد که غلظت IC50 در بازه زمانی 24 ساعت 8 میکروگرم بر میلیلیتر و در بازههای زمانی 48 و 72 ساعت 4 میکروگرم بر میلیلیتر است. بعلاوه، در غلظتهای مساوی و کمتر از 2 میکروگرم بر میلیلیتر بیش از 90 درصد سلولها زنده ماندند، بنابراین بررسی بیان ژنهای، سلولها با غلظت 2 میکروگرم بر میلیلیتر از تیموکوئینون به مدت 24 ساعت تیمار داده شدند. نتایج بدست آمده از مطالعه بیان ژنهای توسط Real-time PCR نشان دهنده کاهش حدود 655/0 و 615/0 برابری (5/38 و 5/34 درصدی) به ترتیب برای ژنهایی iNos و Cox-1، در نمونههای تیمار شده نسبت به کنترل بود (P<0.05). در نتیجه، این مطالعه نشان میدهد که تیموکوئینون قابلیت اثر بر پتانسیل تنظیمکنندگی سیستم ایمنی سلولهای MSC را دارد. همچنین این مطالعه چشمانداز خوبی را برای مطالعات بیشتر در این زمینه و استفاده از این ترکیب برای اثر بر قابلیتهای سلولهای MSC در سلول درمانی را فراهم کرده است.
سلولهای بنیادی مزانشیمی
تیموکوئینون
تنظیم سیستم ایمنی
بیان ژن
2018
09
23
348
360
https://cell.ijbio.ir/article_1326_9997bc989a37f9eb18e0a06aae60c077.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
بررسی قارچهای سیاه ساکن سنگ آرامگاه کورش کبیر
مهناز
قلی پور شهرکی
پریسا
محمدی
قارچهای سیاه به دلیل توانایی بالایی که در تحمل شرایط سخت محیطی دارند از ساکنان اصلی سطوح سنگی در مناطق بیابانی و نیمه بیابانی به شمار میروند و طی رشد در سطح سنگ، اثرات مختلفی بر آن بجا می گذارند. مطالعه حاضر با هدف بررسی تاثیر قارچهای سیاه ساکن سنگ بر آرامگاه کورش کبیر به عنوان یکی از مهمترین بناهای تاریخی ایران انجام شد. با پایش اولیه بنا، حضور این میکروارگانیسمها در جبهههای مختلف آرامگاه نشان داده شد. به منظور ارزیابی کمی و کیفی تاثیر قارچهای سیاه بر بستر سنگی آرامگاه، از قطعات سنگ جدا شده از بنا و سنگهای دارای آثار مشابه از معدن سیوند، نمونهبرداری انجام شد. تهیه مقطع عرضی، رنگ آمیزی PAS و بررسی نتایج با نرمافزار ImageJ انجام گرفت. تأیید نتایج بهدست آمده نیز با استفاده از تصویر برداری با میکروسکوپ الکترونی روبشی صورت پذیرفت. نتایج، حاکی از نفوذ قابل توجه این قارچها در بستر آرامگاه و تاثیر فیزیکی و شیمیایی ناشی از آن در سنگ بستر بود. با توجه به نتایج بهدست آمده، چنین به نظر میرسد در تدوین و اجرای برنامههای حفاظت و مرمت بناهای تاریخی پاسارگاد، توجه به این میکروارگانیسمها بسیار ضروری است.
قارچهای سیاه
آرامگاه کورش کبیر
فرسودگی زیستی
2018
09
23
361
369
https://cell.ijbio.ir/article_1225_58384c3eea4a9886c664c0529ed30aa1.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
باکتری شکارچی هالوباکتریووراکس جدا شده از دریای مازندران و بررسی توانایی کنترل برخی باکتریهای گرم منفی بیماریزا
مجتبی
محسنی
نازلار
محمدحسین زاده
عبدالصمد
کرامت
دلوویبریو و ارگانیسمهای مشابه (BALOs)، گروهی از باکتریهای شکارچی رده دلتا پروتئوباکتر هستند که برخی باکتریهای گرم منفی را شکار میکنند. در این مطالعه، ویژگیهای زیستی جدایهای از BALOs دریایی و کاربرد آن در حذف باکتریهای بیماریزا مورد بررسی قرار گرفت. باکتری شکارچی MMHZ1 به کمک روش آگار دو لایه از آبهای ساحلی دریای مازندران جداسازی شد. از باکتری پروتئوس جدا شده از روده ماهی به عنوان طعمه استفاده شد. جدایه MMHZ1 بسیار پرتحرک و باکتریولیتیک بوده و توانایی تشکیل پلاک بر سطح محیط کشت آگار دو لایه را داشت. مطالعه تعیین توالی ژن 16S rRNA نشان داد که جدایه MMHZ1 دارای 62/99 درصد هومولوژی با هالوباکتریووراکس لیتورالیس (Halobacteriovorax litoralis) بود. همچنین خصوصیات زیستی جدایه نشان داد که pH، غلظت نمک و دمای بهینه رشد جدایه، به ترتیب 2/7، 24/0 درصد و 25 درجه سانتیگراد بود. نتایج نشان داد که جدایه تنها در حضور طعمه زنده رشد و فعالیت داشت در حالیکه توانایی استفاده از طعمه باکتریایی کشته شده با اتوکلاو را نداشت. همچنین بررسی طیف طعمه شامل برخی باکتریهای گرم منفی بیماریزا نشان داد که MMHZ1 توانایی لیز 23/69 درصد از 13 طعمه مورد آزمایش را داشت. نتایج مطالعه حاضر، امکان استفاده از BALOs به منظور کنترل زیستی باکتریهای بیماریزا را نشان داد.
باکتریهای شکارچی
هالوباکتریووراکس
دریای مازندران
کنترل زیستی
2018
09
23
370
385
https://cell.ijbio.ir/article_1422_2c3ba565f0ce8bfd574ffc797b1842a2.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
بررسی و آنالیز بیوانفورماتیک ژن و پروتئین اسکوالن سنتاز در سویه ی بومی آئورانتیوکیتریوم
مجتبی
مرتضوی
شهریار
شاکری
فرشاد
خوش بصیرت
محمود
ملکی
اسکوالن یک تری ترپن غیر اشباع می باشد که کاربردهای گسترده ای در داروسازی دارد. در این تحقیق تولید اسکوالن و بررسی بیوانفورماتیکی ژن آن در سویه بومی آئورانتیوکیتریوم مورد بررسی قرار گرفت. این سویه به ترتیب به میزان 7/3 و 6/1 گرم بر لیتر بیومس و روغن غنی از اسکوالن تولید می کند. مقدار اسکوالن تولیدی توسط این سویه 9/48 میلی گرم بر لیتر می باشد. همچنین ژن اسکوالن سنتاز از این سویه توسط آنالیز مولکولی شناسایی و تعیین توالی شد. بررسی ویژگی کدونی این توالی از نظر تعداد و درصد آنها، مجموع پورین و پیریمیدینها و رسم نمودار گرافیکی آن به کمک نرمافزارهای بیوانفورماتیک انجام شد. به کمک نرمافزارها وپایگاههای مدلسازی، فرایند مدلسازی این آنزیم صورت گرفت. مدل به دست آمده، تأیید کننده نقش اسیدهای آمینه آلانین، گلوتامیک اسید، لوسین در ایجاد ساختار آلفا هلیکس میباشد. این نوع از مطالعات به شناسایی مکانیسم واکنش آنزیم اسکوالن سنتاز کمک میکند. ارزیابی این اطلاعات پنهان می تواند دانش فرایند فولدینگ اسکوالن سنتاز و چالش-های بیان پروتئین را بهبود داده و در طراحی جدید از این آنزیم، موثر واقع شود.
اسکوالن
اسکوالن سنتاز
آئورانتیوکیتریوم
2018
09
23
386
397
https://cell.ijbio.ir/article_1306_02f31d086e819a362a159eca9ae9585a.pdf
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
Cell Mol Res
2383-2738
2383-2738
1397
31
3
تمایز ژنتیکی جمعیتهای لرگ ( (Lam.) Spach Pterocarya fraxinifolia) در ایران با استفاده از نشانگر ISSR
فاطمه
مستاجران
حامد
یوسف زاده
مسلم
اکبری نیا
لرگ گیاهی است درختی، با قدمت کهن در شمال ایران، که به تازگی جمعیتهای کوچکی از آن در غرب ایران، در استانهای لرستان و ایلام نیز گزارش شد. این تحقیق به منظور بررسی میزان تنوع جمعیتی و تمایز جمعیتهای غرب از جمعیتهای هیرکانی و میزان آسیب پذیری آنها براساس نشانگر ISSR انجام پذیرفت. بدین منظور از حدود 10-8 پایه درختی از هر یک از رویشگاههای غرب (استانهای ایلام و لرستان) به همراه چهار رویشگاه در شمال ایران (رضوانشهر، پارک جنگلی نور، سوادکوه و کردکوی) انتخاب، DNA از برگ استخراج و تنوع ژنتیکی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاصل از آنالیز واریانس مولکولی، نشان داد که تنوع مربوط به درون جمعیتها 88 درصد و بین جمعیت ها 12 درصد است. میانگین شاخص شانون برای جمعیتهای مورد مطالعه 157/0 و میانگین هتروزیگوسیتی درون جمعیتی از 064/0 تا 119/0 متغییر است. دندروگرام حاصل از الگوریتم نزدیکترین همسایه، جمعیتها را به دو گروه اصلی طبقه بندی کرد که جمعیت های غربی (لرستان و ایلام) در گروه اصلی اول به همراه جمعیت سوادکوه از شمال ایران قرار گرفتند. آنالیز PCoA نشان داد که جمعیت لرستان با یک فاصله نسبتا زیاد از سایر جمعیتها متمایز است.
تمایز ژنتیکی
تنوع جمعیتی
خوشه بندی
نشانگرهای ژنتیکی
2018
09
23
398
408
https://cell.ijbio.ir/article_1453_1f98fa5ed51f1effa055c12c8b5cf412.pdf