انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
اثرات متقابل ضد باکتریایی اسانس رزماری و اسانس اسطوخودوس برروی دو باکتری گرم مثبت و سه باکتری گرم منفی در محیط آزمایشگاهی
121
136
FA
سلمان
احمدی اسبچین
0000-0001-6079-1842
هیات علمی دانشگاه مازندران
sahmadyas@yahoo.fr
محمد جواد
مصطفی پور
کارشناس ارشد میکروبیولوژی گروه زیست شناسی دانشکده علوم پایه دانشگاه ایلام
javadmostafapur@yahoo.com
اسانس های روغنی نمونه بعد از خشک شدن گیاه در سایه، به روش تقطیر با آب و با استفاده از دستگاه کلونجر جداسازی شدند. اثرات ضد باکتریایی این گیاهان توسط روش انتشار از دیسک وتهیه رقت های متوالی ارزیابی شدند. به منظور کنترل و استاندارد بودن روش، از دیسک های آنتی بیوتیکی و سویه های استاندارد باکتریال استفاده شد. اثرات متقابل نشان داد که در رقت های 1، 2/1 و4/1 اثر بازدارنده گیاه اسطوخودوس بر روی پنج باکتری مختلف با هم نسبت به گیاه رزماری بیشتر و معنی دار است. مقایسه میانگین اثرات متقابل قطر هاله ممانعت از رشد بین باکتری ها و رقت های دو گیاه نشان داد که رقت 1 اسانس ها بیشترین اثر بازدارندگی را بر پروتئوس میرابیلیس دارد. همچنین مقایسه اثرات مختلف اسانس های اسطوخودوس و رزماری بر روی پنج باکتری مختلف با یکدیگر نشان داد که رقت 1، 2/1 و 4/1 اسانس اسطوخودوس بیشترین اثر بازدارندگی را بر پروتئوس میرابیلیس نسبت به باکتری های دیگر دارد و اثر بازدارندگی آن نسبت به گیاه رزماری بیشتر و معنی دار بود. تعیین میزان MIC و MBC اسانس اسطوخودوس و رزماری نشان داد که اثر باکتریواستاتیک اسانس ها بر روی باکتری ها بجز انتروباکتر فکالیس مشابه است البته اثر باکتریوسایدی اسانس ها بر روی تمام باکتری ها بجز باکتری استافیلوکوکوس اپیدرمیدیسمشابه می باشد. نتایج روش انتشار از دیسک نیز در مقایسه با دیسک های آنتی بیوتیک، تاثیر این گیاه را در مقایسه با دیسک های جنتامایسین واسترپتومایسین، درمقابل رشد پنج سویه مورد مطالعه نشان داد.
اسطوخودوس,رزماری,اثرات ضد باکتریال,اسانس
https://cell.ijbio.ir/article_1090.html
https://cell.ijbio.ir/article_1090_62f79f870b0ad4be89509be0126e6c83.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
القاء مقاومت به ویروس برگ بادبزنی مو (GFLV) به روش RNA Silencing
137
150
FA
سمیرا
پاکباز
0000-0003-3392-5248
دانشگاه تبریز
samira.pakbaz@gmail.com
مقصود
پژوهنده
دانشگاه شهید مدنی آذربایجان
pazhouhandeh@gmail.com
امید
عینی گندمانی
دانشگاه زنجان
eini_o@yahoo.com
نعمت
سخندان
دانشگاه تبریز
nsokhandan@yahoo.com
ویروسهای گیاهی از عوامل محدود کننده در کشاورزی به شمار میروند. تاکنون 63 عامل ویروسی آلوده کننده مو در دنیا شناسایی شده است که یکی از مخربترین آنها ویروس برگ بادبزنی مو (Grape Fan Leaf Virus: GFLV) می باشد. برای کنترل ویروسها از روشهای سنتی مثل تناوب گیاهی، تشخیص زودهنگام و حذف گیاهان آلوده، ریشه کنی گیاهان منبع آلودگی، حفاظت تقاطعی، اصلاح برای مقاومت و کنترل شیمیایی ناقلین آنها استفاده شده است. مقاومت به واسطه RNA Silencing یک روش جدید و کارا برای ایجاد ارقام مقاوم به ویروسهاست. در این تحقیق امکان القای مقاومت نسبت به ویروس برگ بادبزنی مو (GFLV) با استفاده از ترادف نوکلئوتیدی بخشی از ژن RNA پلیمراز وابسته به RNA (RdRP) این ویروس بررسی شد. به این منظور یک سازه سنجاق سری حاوی اینترون با استفاده از ترادفی از ژن RdRP ساخته شد. جهت تراریختی توتون از آگروباکتریوم استفاده شد. پس از ایجاد 40 لاین از گیاهان توتون تراریخت، تأیید تراریختی با استفاده از آزمون PCR انجام شد. گیاهان تراریخته به منظور ارزیابی مقاومت آنها نسبت به GFLV، با این ویروس مایهزنی مکانیکی شدند. نتایج آزمون الایزا و نیز علایم ظاهری گیاهان نشان داد که به ترتیب 5/27 و 40 درصد از گیاهان تراریخت نسبت به ویروس مقاوم بوده و یا در بروز علایم و آلودگی تأخیر داشتند. نتایج این تحقیق ضمن ایجاد گیاهان تراریخت توتون متحمل به GFLV نشان داد که سازه بکار رفته برای ایجاد مقاومت کارایی دارد و میتوان از آن برای ایجاد مقاومت در مو و سایر میزبانهای ویروس استفاده کرد.
خاموشی ژن,تراریخت,مقاومت,ویروس برگ بادبزنی مو
https://cell.ijbio.ir/article_1098.html
https://cell.ijbio.ir/article_1098_3f4b56bd927c57b9eb680ddd755340bd.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
ردیابی مولکولی ژن مقاومت ژنوتیپهای گوجه فرنگی نسبت به بیماری شانکر ساقه ناشی از قارچ Alternata alternaria
151
157
FA
خدیجه
پیر فرد
دانش آموخته کارشناسی ارشد دانشگاه پیام نور تهران شرق
محمد علی
ابراهیمی
دانشیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه پیام نور تهران
ma_ebrahimi@pnu.ac.ir
سعیده
پیرایش
دکتری بیماری شناسی گیاهی وزارت جهاد کشاورزی، معاونت زراعت
s_pirahesh@yahoo.com
با گسترش فعالیت قارچهای بیمارگر در گیاهان زراعی، انجام مطالعات دقیق را در بحث کنترل آفات و بیماریهای گیاهی، مهم و ضروری به نظر میرسد. شانکر ساقه گوجهفرنگی که در اثر فعالیت قارچ Alternaria alternata f. sp. lycopersici ایجاد میشود، از مهمترین بیماریهای گوجهفرنگی در ایران است. این قارچ فیتوتوکسینی بنام AAL-toxins تولید میکند که بازدارنده بیوسنتز اسفنگولیپد در گیاه میزبان بوده و باعث شانکر ساقه میشود. مقاومت در برابر پاتوژن و عدم حساسیت به توکسین، توسط جایگاه ژنی ASC1 در گیاه میزبان کنترل میشود. پروتئین حاصل از بیان این ژن، قادر به سم زدایی AAL-Toxin است. این تحقیق با هدف ردیابی این ژن در34 ژنوتایپ مهم مورد استفاده در ایران انجام شد. پس از ساخت آغازگر مناسب برای ردیابی ژن دخیل در مقاومت گوجه فرنگی به بیماری شانکر ساقه و این ژن طی واکنش PCRدر ارقام مورد آزمایش ردیابی گردید. سپس محصول PCR توالییابی شده و نتیجه سکوئنس نشان داد که باند ایجاد شده مربوط به ژن مورد نظر می-باشد که از بین ژنوتایپهای مورد آزمایش ارقام کال جیN3، اکسیر فلات،VF Early urbana ، اوان، هیبریدps515، CHفلات، متین، Bonny Bost، هیبرید ایون، دارای ژن ASC-1بودند و برای اولین بار در ایران با روشهای مولکولی به عنوان ژنوتایپهای دارای ژن مقاوم به شانکر ساقه برای مطالعات بعدی معرفی شدند.
ارقام مقاوم,Alternaria alternata,شانکرساقه,گوجه فرنگی
https://cell.ijbio.ir/article_1105.html
https://cell.ijbio.ir/article_1105_db3ab642ac75bf3778d8950107735d29.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
ارزیابی فعالیت آنتی اکسیدانی و مهار آنزیم آلفا آمیلاز دو گونه Sargassum angostifolium و Palisada perforata
158
171
FA
کیانا
پیریان
دانش آموخته دکتری گروه بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا همدان
kianapirian@yahoo.com
سهیلا
معین
عضو هیات علمی گروه بیوشیمی و معاون پژوهشی دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان
soheila_9@yahoo.com
جلوه
سهرابی پور
عضو هیات علمی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان هرمزگان
sohrabipour2@gmail.com
رضا
ربیعی
عضو هیات علمی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان هرمزگان
r.rabie6746@gmail.com
خسرو
پیری
مدیر کل دفتر برنامه ریزی و پژوهشی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری
khpiri@gmail.com
بیماری دیابت نوع دو، ناشی از اختلال در عملکرد و ترشح انسولین و به دنبال آن افزایش میزان قند خون است که به سومین عامل مرگ و میر در جهان تبدیل شدهاست. مشتقات فعال اکسیژن از جمله عوامل آسیب و مرگ برنامهریزی شده سلولی و دیابت می-باشند. اثرات جانبی مخرب مصرف داروهای سنتزی بر بیماران، تحقیقات را به سمت داروهای طبیعی متمایل کردهاست. در این تحقیق، فعالیت آنتیدیابتی و آنتیاکسیدانی سه عصاره متانولی، اتیلاستاتی و انهگزانی دو گونه ماکروجلبک Palisada perforata و Sargassum angostifolium بررسی شدهاست. نمونههای جلبک پس از جمعآوری از سواحل خلیجفارس و آمادهسازی، به روش پرکولاسیون عصارهگیری شدند. فعالیت مهارکنندگی آنزیم آلفاآمیلاز غلظتهای مختلف نمونهها بر اساس روش DNS و ظرفیت آنتیاکسیدانی آنها نیز براساس دو روش تخریب رادیکال آزاد ABTS+ و احیاکنندگی FRAP بررسی شد. عصاره اتیلاستات S. angostifolium و P. perforata به ترتیب بیشترین و کمترین فعالیت بازدارندگی آنزیم آلفا آمیلاز را نشان دادند (P<0.05). همچنین بالاترین ظرفیت آنتیاکسیدانی پاکسازی +ABTS و احیاکنندگی FRAP به ترتیب در نمونه-های اتیلاستات S. angostifoliumو P. perforata مشاهده شد (P<0.05). به طورکلی عصارههای قطبی و نیمه قطبی در هر دو گونه فعالیت آنتیاکسیدانی بالاتری را نسبت به عصاره غیرقطبی آن گونه نشان دادند و گونه S. angostifolium بالاترین فعالیت را برای هر دو سنجش مهار آنزیم آلفاآمیلاز و تخریب رادیکال آزاد ABTS+ نشان داد. دو گونه جلبک خوراکی مورد تحقیق با نشان دادن فعالیت قابل توجه آنتیدیابتی و آنتیاکسیدانی، با تحقیقات تکمیلی دارای پتانسیل کاربرد مستقیم در رژیم غذایی و همچنین استفاده در صنایع پزشکی و داروسازی میباشند.
ماکروجلبک,خلیج فارس,آنزیم آلفا آمیلاز,Sargassum angostifolium,Palisada perforata
https://cell.ijbio.ir/article_1097.html
https://cell.ijbio.ir/article_1097_130ed609e2a4bc2a2c43845dfaa3a0ef.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
تنوع ژنتیکی ارقام نخل خرما در استانهای سیستان و بلوچستان و هرمزگان با ریزماهواره
172
186
FA
حسام الدین
تقی نژاد
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه زابل
hesam.taghinejad@yahoo.com
لیلا
فهمیده
0000-0002-1234-1166
استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی دانشگاه زابل
leila.fahmideh@yahoo.com
داوود
صمصام پور
استادیار گروه باغبانی دانشگاه هرمزگان
davood.samsampoor@gmail.com
مجید
عسکری سیاهویی
استادیار مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان هرمزگان، (بندرعباس)
majeed.askaryesyahooi@yahoo.com
با توجه به اهمیت اقتصادی خرما، در این پژوهش تنوع ژنتیکی 14 رقم نر و 26 رقم ماده نخل خرما با استفاده از آغازگر SSR مورد ارزیابی قرار گرفت. استخراج DNA به روش CTAB انجام شد و با استفاده از 10 جفت آغازگر SSR تکثیر گردید. محصولات تکثیر شده با استفاده از ژل اکریل آمید 8% و رنگآمیزی با نیترات نقره مشاهده شدند. با استفاده از نرم افزار Gene Alex6.3 نتایج مربوط به تعداد آلل مشاهده شده، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و محتوای اطلاعات چند شکلی محاسبه شد. از روش تجزیه خوشهای Nearest joining برای گروهبندی استفاده شد و فاصله ژنتیکی بین ارقام از طریق ضریب تشابه نی محاسبه گردید. نتایج نشان داد که محتوای اطلاعات چند شکلی از 63% برای آغازگر HQ542225 تا 85% برای آغازگر HQ542208 و با متوسط 77% متغیر بود. تعداد آلل در هر جایگاه از 6 تا 9 متغیر و با میانگین 6/7 بدست آمد. از 10 جفت آغازگر مورد استفاده در مجموع 76 آلل شناسایی شد که آغازگرهای HQ542208 و HQ542224 با 9 آلل بیشترین و آغازگرهای DP169 و HQ542225 با 6 آلل کمترین تعداد آلل را نشان دادند. بیشترین تشابه ژنتیکی بین ارقام آلمهتری و خنیزی و کمترین میزان تشابه بین رقم ابونارنجا و سایر ارقام بود. با توجه به یافتههای حاصل از این پژوهش، تصویر جامعتری از ساختار ژنتیکی ارقام نر و ماده نخل خرما بدست آمده است که استفاده از آنها را برحسب مورد در برنامه بهنژادی ارقام نخل خرما ممکن میسازد.
ارقام نر و ماده,تنوع ژنتیکی,تجزیه خوشهای,نخل خرما,آغازگر SSR
https://cell.ijbio.ir/article_1335.html
https://cell.ijbio.ir/article_1335_3095188e4abbcee46aad5f45cff9d99f.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
تاثیر غلظت های مختلف کانسنگ اورانیوم در فرآیند بیولیچینگ از طریق آنالیز بیان ژن سیتوکروم A1 باکتری اسیدیتیوباسیلوس گونه FJ2
187
199
FA
سمانه
جهانی
گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم، واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی، قم، ایران
jahani777@yahoo.com
فائزه
فاطمی
دانشیار، پژوهشکده مواد و سوخت هسته ای، پژوهشگاه علوم و فنون هسته ای، سازمان انرژی اتمی، تهران، ایران
ffatemi@aeoi.org.ir
سبا
میری
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده زیست شناسی، دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران
sabamiri70@gmail.com
فرایند اکسیداسیون و احیاء کانسنگ اورانیوم توسط باکتری اسیدیتیوباسیلوس فرواکسیدانس، با کمک زنجیره انتقال الکترون انجام می گیرد که یکی از مهم ترین اجزاء این زنجیره که در فرایند اکسیداسیون آهن دخیل است، ژن cycA1 می باشد. در این پروژه، جهت افزایش راندمان بیولیچینگ اورانیوم، بیان ژن cycA1 در باکتری اسیدیتیوباسیلوس فرواکسیدانس در حضور چگالی های مختلف از کانسنگ اورانیوم، بررسی شده است. بدین منظور، باکتری مورد نظر در حضور چگالی پالپ های مختلف از کانسنگ اورانیوم (5/2، 5، 10 و 25%)، کشت داده شد. در توالی های 24 ساعته میزان استخراج اورانیوم، تغییرات pH ، Eh و آهن فریک آنها اندازه گیری شد. زمانی که بازده استخراج اورانیوم به 100% رسید، بیان ژن cycA1 باکتری با استفاده از روش Real-time PCR مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از آزمایشات نشان داد، با افزایش میزان چگالی پالپ، سرعت استخراج اورانیوم و فعالیت اکسیداسیونی باکتری کاهش پیدا کردند. همچنین، بیان ژن cycA1 درحضور کانسنگ اورانیوم به نسبت نمونه عاری از کانسنگ افزایش مییابد و با افزایش بیشتر چگالی پالپ، به دلیل سمیت اورانیوم، روند کاهشی مشاهده شد. نتایج حاصل از آزمایشات نشان میدهد تغییرات Eh، pH و استخراج اورانیوم در فرآیند بیولیچینگ توسط باکتری اسیدیتیوباسیلوس با چگالی پالپ بالای کانسنگ نسبت به باکتریهای کشت یافته با چگالی پالپ پائینتر به تأخیر افتاده است. نتایج حاصل از بررسی بیان ژن cycA1 باکتری در غلظت های مختلف کانسنگ نشان داد که غلظت کانسنگ بر روی بیان ژن های مذکور موثر بوده است.
باکتری اسیدیتیوباسیلوس فرواکسیدانس,سیتوکروم A1,اکسیداسیون آهن,بیولیچینگ اورانیوم
https://cell.ijbio.ir/article_1300.html
https://cell.ijbio.ir/article_1300_11731de6ac874206262b056926d774cb.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
بررسی مراحل نموی و امکان رویان زایی از میکروسپورآویشندنایی(Thymus daenensis)
200
209
FA
امین
حیدری
دانش آموخته کارشناسی ارشد پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی
heydari35@gmail.com
جواد
هادیان
هیات علمی پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی
j_hadian@sbu.ac.ir
محمد حسین
میرجلیلی
هیات علمی پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی
m-mirjalili@sbu.ac.ir
علیرضا
کرمی
دانش آموخته کارشناسی ارشد پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی
karami.ha75@yahoo.com
محمد رضا
کنعانی
هیات علمی پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی
mrz_kanani@yahoo.com
آویشن دنایی (Thymus daenensis Celak) به دلیل داشتن تیمول بالا در اسانس به عنوان یکی از گیاهان با ارزش دارویی شناخته میشود. به همین جهت، اهلی کردن و ایجاد ارقام مرغوب و همگن از آن جهت کشت و تولید تجاری ضروری میباشد. هدف از تحقیق حاضر بررسی امکان باززایی گیاهان هاپلوئید از کشت میکروسپور این گیاه بوده است. از آنجا که بیشتر گونههای گیاهی در مرحله تکهستهای نمو میکروسپور بهترین پاسخ را میدهند، در تحقیق حاضر ابتدا مراحل نموی میکروسپور تعیین شد. نتایج بدست آمده گواه بر این بود که غنچههای دارای میانگین قطر3/1 تا4/1 میلیمتر و میانگین طول 8/3 تا 4/4 میلیمتر حاوی میکروسپور تک هسته ای میباشند. به منظور القاء جنین زایی، تاثیر پیش تیمارهای مختلف دمایی (30 و 4 درجه سانتیگراد)، هورمونی(25، 35 و 45 پی پی ام 2,4-D) و سه محیط کشت FHG، NLN-13، B5 بر جنین زایی میکروسپور بررسی شد. نتایج نشان داد که تفاوت معنی داری بین محیطهای القاء، پیش تیمارها و همچنین اثر متقابل محیط القاء و پیش تیمار وجود دارد. بیشترین تعداد ساختار چند سلولی در محیط NLN-13 و پیش تیمار گرما به مدت 8 روز و پیش تیمار 2,4-D با غلظت 25 پیپی-ام مشاهده شد. در نهایت فقط در محیط FHG و پیش تیمار گرما به مدت 8 روز جنینها تا مرحلهی قلبی شکل نمو یافتند. مطالعات بیشتر برای افزایش ساختارهای چند ساولی و نمو جنینها به گیاه هاپلوئید نیاز است.
اصلاح,گیاهان هاپلوئید,میکروسپور تک هسته ای,جنین زایی
https://cell.ijbio.ir/article_1293.html
https://cell.ijbio.ir/article_1293_b1ab6e38eefa1d6e24d1591c7f14431e.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از جمعیتهای گیاه خارمریم با استفاده از نشانگر مولکولی
210
221
FA
نوید
زمانی
مربی دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست دانشگاه صنعتی خاتم الانبیاء بهبهان، بهبهان
zamani@bkatu.ac.ir
خالد
میرزایی
گروه زیست شناسی/ دانشگاه لوون/ بلژیک
khaled.mirzayi@gmail.com
وحید
زمانی
مربی، دانشگاه ژوزففوریر، دانشکده اکولوژی آلپین، گرونوبل، فرانسه
zamani_wahid@yahoo.com
خارمریم از خانواده کاسنی، یکی از گیاهان دارویی با خصوصیات دارویی منحصر به فرد در درمان بیماریهای کبد است که در بسیاری از مناطق ایران رشد میکند. در این مطالعه از نشانگر SCoT برای مطالعه تنوع ژنتیکی 38 نمونه خارمریم از مناطق مختلف استانهای خوزستان و ایلام استفاده شد. در مجموع 146 قطعه تکثیر شد و 69% از آنها چندشکلی بودند. بیشترین تعداد قطعات تکثیر شده مربوط به آغازگر SCoT10 با 12 قطعه و کمترین تعداد قطعات تکثیر شده مربوط به آغازگرهای SCoT22، SCoT47 و SCoT55 با شش قطعه بود. متوسط تعداد باند برای هر آغازگر 58/8 و متوسط باندهای چندشکلی 6 بود. محتوی اطلاعات چندشکلی و قدرت تفکیک (PICD) بین 089/0 در آغازگر SCoT22 و 219/0 در آغازگر SCoT31 با میانگین 151/0 متغیر بود. ماتریس تشابه با استفاده از ضریب جاکارد، تجزیه خوشهای با الگوریتم UPGMA و تجزیه به مختصات اصلی انجام شد. براساس تجزیه خوشهای، نمونههای خارمریم به 3 گروه تقسیم شدند. براساس ماتریس تشابه، کمترین شباهت (44/0) مربوط به دو نمونه ایوان و بهبهان، و همچنین بیشترین شباهت (92/0) بین دو نمونه از میانآب از یک منطقه جغرافیایی مشابه بود. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که سطح بیشتری از تنوع به درون جمعیتها (89 درصد) تعلق داشت، درحالی که تنها 11 درصد تنوع در بین جمعیتها مشاهده شد. در نهایت نتایج نشاندهنده تنوع زیاد در بین ژنوتیپهای مورد مطالعه بود.
گیاه دارویی,نشانگر SCoT,محتوی اطلاعات چندشکلی,قدرت تفکیک,Silybum marianum L
https://cell.ijbio.ir/article_1101.html
https://cell.ijbio.ir/article_1101_b9e3537b694e27fc97e60decd3fa3cef.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی بخشی از ژن GH و ارتباط آن با صفات لاشه در گوسفندان افشاری و افشاری-برولا مرینو
222
232
FA
رحیمه
سپهری
0000-0001-5378-7271
دانش آموخته دکتری گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
sepehri_r@znu.ac.ir
طاهر
هرکی نژاد
0000-0001-9037-824X
زنجان، دانشگاه زنجان، پژوهشکده فناوریهای نوین زیستی
taher.harkinezhad@znu.ac.ir
ضادق
علیجانی
عضو هیات علمی دانشگاه تبریز
alijani_sa@hotmail.com
جلیل
شجاع
عضو هیات علمی دانشگاه تبریز
shojae_dj@hotmail.com
سیدعباس
رافت
عضو هیات علمی دانشگاه تبریز
abbasrafat@hotmail.com
نواحی اگزون 5 و بخشی از ناحیه 3′ UTR بود. برای این منظور تعداد 133 رأس بره از یک گله و در سن تقریبا یکسان در سه گروه افشاری خالص، آمیخته افشاری- برولامرینو نسل F2 و F5 مورد استفاده قرار گرفتند. قبل از کشتار از این دامها نمونه خون تهیه شد. پس از انجام اندازه-گیریهای فنوتیپی بر روی دام زنده، تعداد 85 رأس از این دامها کشتار شدند. پس از کشتار، وزن لاشه اندازهگیری شد و بعد از 24 ساعت ماندن لاشه در سردخانه، وزن ران، سردست، قلوهگاه، دنبه و ضایعات اندازهگیری شد. برآورد صفات لاشه در دامهای کشتار نشده، با استفاده از ضرایب رگرسیونی انجام شد. از نمونههای خون به روش فنل-کلروفرم DNA استخراج گردید. سپس با استفاده از پرایمرهای طراحی شده، قطعه موردنظر تکثیر ومستقما توالییابی گردید. پس از آنالیز توالیها، ارتباط ژنوتیپها با صفات لاشه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد جایگاه نوکلئوتیدی 2846 دارای دو ژنوتیپ TT و TC بود که بر اندازه طول بدن دام در دامهای افشاری خالص و F5 تأثیر داشت. در جایگاه نوکلئوتیدی 2882 یک نوکلئوتید در برخی از دامها به توالی اضافه شده بود که این ژنوتیپ فقط در دامهای F2 با ضایعات(چربی) لاشه ارتباط داشت. این نتایج نشان میدهد که از تغییرات نوکلئوتیدی مشاهده شده در صورت تائید در دیگر بررسی های مربوطه میتواند در برنامه انتخاب دام به کمک مارکرها مورد استفاده قرار گیرد.
گوسفندافشاری,هورمون رشد,چند قلوزایی,کیفیت لاشه,SNP
https://cell.ijbio.ir/article_1094.html
https://cell.ijbio.ir/article_1094_a6138b2f809d67057e70877260181a46.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
بررسی نفوذ داروهای آسپیرین و ایبوپروفن در غشاء دولایه لیپیدی به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی
233
257
FA
غلامحسین
صدیفیان
دانشگاه کاشان
sodeifian@kashanu.ac.ir
حسین
رضایی مارنانی
دانشگاه کاشان
h.r.chemeng@gmail.com
فریبا
رزمی منش
دانشگاه کاشان
f.razmimanesh69@yahoo.com
برهمکنش دو نوع داروی ضدالتهاب غیراستروئیدی آسپرین و ایبوبروفن همراه با یک غشاء مدل دولایه لیپیدی به کمک شبیهسازی دینامیک مولکولی (Molecular Dynamic Simulation) بررسی شد. به منظور مطالعهی تاثیر نوع دارو، حالت باری دارو، دوز دارو و وجود پروتئین غشائی انتگرالی بر نفوذ دارو در غشاء، 11 سیستم مختلف با شرایط یکسان شبیهسازی گردید. در هر سیستم 4 پارامتر نشاندهندهی نفوذ و 9 پارامتر موثر بر نفوذ آنالیز شد. این پارامترها، خصوصیات مختلف غشاء، خصوصیات دارو، همچنین برهمکنشهای مختلف میان غشاء و دارو و نیز آب و پروتئین را شامل گردید. نفوذ دارو برای هر پارامتر سیستمهای مورد مطالعه، امتیازدهی و رتبهبندی انجام شد. بعلاوه، پارامترهای موثر کنترلکنندهی نفوذ در هر دو وضعیت وجود و عدم وجود پروتئین تعیین گردید. سیستمهای حاوی آسپیرین بهتر از ایبوپروفن، با دوز پایین بهتر از دوز بالا، خنثی بهتر از باردار و با پروتئین بهتر از بدون پروتئین، نشاندهندهی علائم نفوذ بودند. نتایج نشان داد که در سیستمهای بدون پروتئین، پیوند هیدروژنی دارو و آب، و در سیستمهای با پروتئین، پیوند هیدروژنی پروتئین با آب و لیپید به عنوان پارامتر موثر کنترلکنندهی نفوذ عمل می نماید.
داروی ضدالتهاب غیراستروئیدی,غشاء دولایه لیپیدی,شبیهسازی دینامیک مولکولی,نفوذ,حالت بار
https://cell.ijbio.ir/article_1103.html
https://cell.ijbio.ir/article_1103_87ef7076c9c3b19f4607c2c2c353422c.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
بررسی سازوکار انتقال انتخابی از میان کمپلکس منفذ هسته سلول با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی
258
268
FA
زینب
قسمتی
دانشگاه تحصیلات تکمیلی در علوم پایه زنجان
z.ghesmati@gmail.com
سارا
محمدینژاد
دانشگاه تحصیلات تکمیلی در علوم پایه زنجان
sarah@iasbs.ac.ir
کمپلکسهای منفذ هسته (NPCs) گذرگاههای دوطرفه انتخابی بین هسته و سیتوپلاسم هستند. درحالیکه مولکولهای کوچک میتوانند آزادانه از میان NPCها انتشار یابند، مولکولهای بزرگ تنها به واسطه اتصال به گیرندههای انتقالی، میتوانند از خلال آنها عبور کنند. کانال مرکزی NPC با پروتئینهای نامنظم غنی از تکرارهای فنیل آلانین-گلایسین (FG) پوشیده شده است که به عنوان ناپِ FG شناخته میشوند و ادعا میشود این پروتئینها مسئول عملکرد انتخابی NPCها هستند. در این مقاله رفتار انفرادی و دستهجمعی Nsp1، به عنوان نمایندهای از ناپهایِ FG، با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی درشتدانه مطالعه شده است. در مدل درشتدانه ما، قدرت آبگریزی متفاوت آمینواسیدها به خوبی لحاظ شده است. نتایج شبیهسازیهای ما نشان میدهد ناپهایِ FG انفرادی، در حالت تعادل ساختارهای گلبولی دارند در حالیکه آرایهای از ناپهایِ FG متصل شده به یک سطح، ساختارهایی کشیده و برسمانند تشکیل میدهند. همچنین گیرنده انتقالی NTF2 علاوه بر نفوذ به درون ساختار برسی منجر به فروریختگی آن نیز میشود. این مشاهدات نشان میدهند مدل دروازه مجازی میتواند مدل پیشنهادی مناسبی برای سازوکار انتقال انتخابی از میان NPCها باشد.
کمپلکس منفذ هسته,شبیهسازی دینامیک ملکولی درشتدانه,انتقال انتخابی, ساختار برسمانند,گیرندههای انتقالی
https://cell.ijbio.ir/article_1100.html
https://cell.ijbio.ir/article_1100_147cebc18e92ecf47036fd53b9a0212a.pdf
انجمن زیست شناسی ایران
پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران)
2383-2738
2383-2746
31
2
2018
07
23
تأثیر غلظتهای مختلف 2,4-D بر جنینزایی رویشی چند ژنوتیپ هویج ایرانی
269
278
FA
مصطفی
ناصری
دانشجوی کارشناسی ارشد علوم و تکنولوژی بذر، دانشکده کشاورزی- دانشگاه یاسوج
naserimostafa35@yahoo.com
حمیدرضا
بلوچی
0000-0001-8015-3215
دانشگاه یاسوج / عضو هیات علمی گروه زراعت و اصلاح نباتات
balouchi@yu.ac.ir
اسد
معصومی اصل
دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی- دانشگاه یاسوج
masumiasl@yahoo.com
علی
مرادی
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی- دانشگاه یاسوج
amoradi@yu.ac.ir
با توجه به توانایی تولید جنین از سلولهای رویشی، جنینزایی رویشی میتواند مقدمه تولید بذر مصنوعی باشد. لذا تحقیق حاضر با هدف تعیین مناسبترین ژنوتیپ و تنظیم کننده رشد گیاهی جهت تولید پینههای جنینزا بصورت آزمایش فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در محیط پایه 25 درصد MS، اجرا گردید. عامل اول شامل نه ژنوتیپ هویج ایرانی و عامل دوم، تنظیم کننده رشد گیاهی در چهار سطح (شاهد، 2 ،4 و 6 میلیگرم بر لیتر 2,4-D) بود. از کشت درون شیشهای بذرها جهت تولید گیاهچه و از هیپوکوتیل گیاهچههای تولید شده برای تولید پینه جنینزا استفاده شد. 12 هفته بعد از کاشت ریزنمونهها، صفات درصد پینهزایی، طول و قطر پینه، وزن تر و خشک پینه و نیز نوع بافت، رنگ و وضعیت جنینزایی پینهها ارزیابی گردیدند. همچنین تعداد جنینهای کروی، قلبی و اژدری شکل در پینههای جنینزا شمارش شدند. نتایج نشان داد که بیشترین درصد پینهزایی (100 درصد) در ژنوتیپهای 26-99 (بدون حضور تنظیم کننده رشد گیاهی) و 31-99 (در حضور 4 میلیگرم بر لیتر 2,4-D) بدست آمد؛ تشکیل پینه جنینزا در ژنوتیپهای 16-99، 27-99 64-99 و 40-99 در حضور 2 میلیگرم بر لیتر 2,4-D و ژنوتیپهای 56-99 و 31-99 در حضور 4 میلیگرم بر لیتر 2,4-D مشاهده شد. ژنوتیپ 64-99 بیشترین تعداد جنین کروی (13 عدد)، قلبی (33/5 عدد) و اژدری (33/3 عدد) را تولید کرد. لذا ژنوتیپ 64-99 و غلظت 2 میلیگرم بر لیتر 2,4-D برای تولید بیشترین تعداد جنین رویشی مناسب میباشد. درکل ژنوتیپهای هویج ایرانی پاسخ متفاوتی به پینهزایی و جنینزایی نشان دادند
پینه,ژنوتیپ,جنینزایی رویشی,تنظیم کننده رشد گیاهی
https://cell.ijbio.ir/article_1096.html
https://cell.ijbio.ir/article_1096_56d967270b8fc6bbd6d84a7255727684.pdf